（二）明清时期的全真道和内丹学
明代全真一系道士多高隐深遁，修习内丹，促进了内丹学的继续发展。明初全真一系道士以武当山张三丰声望最高。张三丰，名君宝，又名全一，号张邋遢，曾与其徒居武当山，预言“此山异日必大兴”，后云游天下，明帝屡访不遇。张三丰道功甚高，有神异，又享高寿，其在道教中的影响可比于吕洞宾，而后社会上的武术家、内丹家，以及讲房中术、导引健身术的江湖术士，皆称张三丰为祖师。内丹学中，亦添武当山三丰派，称传自陈传一系的火龙真人，清代李西月编有《张三丰先生全书》。张三丰派门人号其内丹为隐仙派，修道尚高隐，但不尚出家，此派还传陈抟的“蛰龙法”，乃是一种以卧式行气的内丹睡功。
明代在丘处机的龙门派下，有龙门律宗以戒律密传，由赵道坚以次递传张德纯、陈通微、周玄朴。周玄朴分传张静定、沈静圆二支派。张静定传赵真嵩，赵真嵩传王常月。王常月（1522—1680）号昆阳子，山西潞安人，为龙门第七代律师，于清初公开传初真、中极、天仙“三坛大戒”，大阐宗风，主讲于白云观，度弟子千余人，遍及全国。其徒众将其语录编成《龙门心法》（又称《碧宛坛经》）_二卷，主命在性中，以见性为修炼之本。沈静圆一系经卫真定传至沈常敬（1523- 1653），号太和子，居茅山乾元观，传孙守一（名玉阳）、黄守圆（名赤阳），门徒渐盛，分派增多。尔后，龙门派弟子在各地开山授戒，形成很多龙门支派。
明万历时，有扬州兴化县陆西星（ 1520～1606），字长庚，号潜虚。陆长庚早年儒冠，九试不第而为道士，暮年又习佛教密宗，融三教于一身。陆长庚以扶乩托言吕祖降其草堂，亲授丹诀，将其《参同契测疏》、《悟真篇注》、<金丹就正篇》、《七破论》、《（玄肤论》等十余种丹经编为《方壶外史丛编》，又著《南华副墨）》和《楞严经述旨》等书。陆氏内丹主张男女双修，开内丹学东派。
沈常敬一系的龙门律宗金盖山云巢支派道士闵小艮（1758—1836），派名一得，从高东篱（1621—1768）受戒，又得沈一炳（1708 - 1786）丹诀，撰《金盖心灯>，又编成《古书隐楼藏书》，收内丹等道书28种。清末道士黄元吉撰《乐育堂语录》、<道德经注释》，以守中为炼丹之道。
云南鸡足山，另有月支国人黄守中（原名野怛婆阁，自印度来华，由王常月授戒），号鸡足道者，传“龙门西竺心宗”。该派习诵咒，有神通，闵小艮亦从学斗法秘术。其弟子有管太清、王太原，后传王清楚、白马李、云大辫，李赤脚、章大亨、郭阳晓、张蓬头等。
江西吉安人伍守阳（1565一1644），号冲虚子，得王常月传戒，受由虎皮张静虚真人经李虚庵至曹常化所传丹法，著有《天仙正理直论》、《仙佛合宗语录》。清代僧人柳华阳撰（（金仙证论》、《慧命经>发挥伍守阳之内丹学，世称伍柳派。伍柳派内丹属先性后命的北派清静丹法，佛教色彩较浓。
清道光年间，又有四川乐山人李西月，号涵虚，自称曾从张三丰真人受丹法，编《张三丰先生全书》，又称遇吕洞宾授以丹诀，编<吕祖年谱》。李西月以陆西星后身自居，著《三车秘旨》、<道窍谈》、《后天串述》、（（无根树词解》等，创西派丹法。
全真门下谭处端所传南无派，传于第二十代宗师刘名瑞（1839一1931），号盼蟾子，有《盼蟾子道书三种》传世，阐述南无派内丹。
明嘉靖时，崂山道士孙玄清（1517—1569），字金山，创龙门支派金山派，其丹诀代有传人。金山派丹功为清静丹法，由聚光止念入手。
龙门派第十一代道士刘一明（1734一1821），号悟元子，在甘肃修道，著《道书十二种》，其丹法融汇理学，从炼性人手，循序渐修。称内药了性，外药了命，内药为自身元性，外药为虚空中真一之熙（元命），又分丹功为上、中、下三等。
又有道教居士傅金铨，编著《道书十七种，力主同类阴阳择鼎铸剑的栽接丹法，其《丹经示读》，讲以双修观点理解丹经的方法。另有《性命圭旨》，称尹志平弟子撰．《唱道真言》，由扶乩降授，皆为重要丹经。
清代龙门支派甚多，如吕守璞开苏州冠山支派陶靖庵开湖州金盖山云巢支派；郭守贞传沈阳太清官道团；徐守诚传江南西山万寿宫道团．曾一贯传广东罗浮山冲虚古观道团，齐守本创金辉派，张宗璇创霍山派，不一而足。