刘存厚增派部队进入成都，川黔军于成都巷战。7日晨，川军占领东西两校场，黔军焚毁民房六七千户，移人皇城固守。贵州督军刘显世通电声讨刘存厚，宣布派遣黔军三梯团，分赴川境，增援驻川黔军。9日，原退守川南的罗佩金通电宣布“即日西上”，调解川黔军队冲突，并分电戴戡、刘存厚“严束所部，立即停战”。川军师长周道刚、熊克武通电报告川黔军冲突情形，提出川滇军诸师长兼程赴成都，共谋解决川黔两军冲突，川中事务仍由戴戡主持，请唐继尧、刘显世令滇黔军队停止前进。刘存厚亦致电冯国璋、段祺瑞，表示愿静候中央解决。黔军因不见援军，伤亡严重，弹药匮乏，旋在省议会和英、法领事调停下，戴戡表示愿意退出成都，将督军、省长、会办印信交省议会。13日，川军放开南门让黔军退出，但黔军疑惑埋伏，抢掠粮食后，又退回皇城。16日，川军攻破成都皇城，黔军求和，双方达成黔军撤出成都四项协议，戴戡将督军、省长、会办三方印绶交省议会。同日，唐继尧以声援黔军为名，宣布“刻即躬率三军，吊民伐罪”。17日，戴戡率黔军残部退出成都，刘存厚率川军人城，通电宣布“仍以军长名义暂维秩序”。18日，冯国璋以川黔两军冲突，令戴戡、刘存厚“各约束所部”，“静候中央处理”。20日，唐继尧通电躬率靖国军由滇自行人川，先平“川乱”。21日，黔军行至仁寿县秦皇寺时遭川军袭击，戴戡被击毙，熊其勋为川军俘获后斩首，黔军余部溃散。23日，云南靖国军第三混成旅司令李友勋率队启程赴川。滇军分路进攻资阳、井研、仁寿、嘉定、犍为等县，21日占寿阳、眉山两县，26日占嘉定，7月下旬相继攻破犍、井、资等县。24日，冯国璋特任川军第一师师长周道刚暂代四川督军，并派长江上游巡阅使吴光新为四川查办使，率北军进入四川。27日，冯国璋以刘存厚拒不遵命罢兵，令周道刚率师进解成都之围。29日，刘存厚通电，决心联合川中各师抵抗滇黔军，并“请中央迅颁挞伐，力遏横流”。8月1日，滇军自嘉定进袭眉山张家坎，川军二师由夹江乘虚占嘉城。同日，川军三师复占资阳。2日，经一周激战，进攻眉山之滇军伤亡惨重，川军乘胜进逼青神。3日，川军反攻再占仁寿。6日，川军师长周道刚、熊克武再电川滇两军将领，吁请停战。驻川汉军统弁杨骁骑率部复占犍为县，滇军退叙府（今宜宾市）、屏山县。7日，罗佩金复电川军周、熊二师长，接受调停。8日，钟体道、张澜亦电告听候调处。同日，国务院开会讨论四川问题，由蒋百里报告川事经过及戴戡死亡情状，梁启超主张严惩刘存厚，段祺瑞不允，结果由冯国璋令刘存厚、罗佩金即日来京，所有部队交周道刚统辖，“其滇黔现调赴川军队，并应即行撤退”，并令财政部拨银20万元赈成都兵灾。10日，周道刚在重庆就职。13日，川军占青神，滇军退走井研县。滇军攻川基本告终。
驻广东阳山县滇军第六团第三营兵士因索饷哗变，先抢劫县属青莲墟，后试图往县城抢劫，经城中军警抵御而窜散。
7月6日。张勋通电辞职。张勋见大势已去，辞去“内阁议政大臣”等职，主张由徐世昌组织完全内阁，在徐来京之前，所有阁务统交王士珍暂代执行。并再次供称徐世昌、冯国璋对于复辟主张“尤深赞许，信使往返，俱有可证”，同时请各国公使出面调停。7日，康有为致函徐世昌，力请维护复辟残局，谓：若公不能力争，致撤销复辟，则咎有攸归，情同附逆。8日，溥仪发布“谕旨”，开去张勋“内阁议政大臣暨直隶总督兼北洋大臣”职务，内阁政务暂由王士珍等办理，并俟徐世昌来京会同筹商善后。
冯国璋在南京就任代理大总统。冯国璋见时机成熟，宣布就任代理大总统，并特任段祺瑞为国务总理，任倪嗣冲为“讨逆军南路总司令”，以收束张勋部属，规定所有沪、杭、赣各师旅统归倪嗣冲节制。同日，李纯下令动员誓师北伐，宣布自任赣省北伐军总司令，编组一、二两军，先遣队相继出发。浙江督军杨善德、省长齐耀珊通电拥护冯国璋继任大总统，请段祺瑞统师北伐；并于督署开军事会议，议决编组混成支队出师讨逆，支队开抵上海转赴南京，编人南路北伐军，受倪嗣冲节制。
7月7日冯国璋发布命令惩办祸首6日，段祺瑞发布惩办祸首令，着传知前敌各军严拿务获张勋，尽法惩治。是日，冯国璋令褫去安徽督军张勋本职并军职、勋章、勋位，特任倪嗣冲兼署安徽督军，齐耀琳暂兼代江苏督军；着免直隶省长朱家宝本职，以曹锟兼署。冯国璋并以讨逆军荡平张勋逆军之期即在指日，令所有各省军队，除业经调遣外，均应各驻原防，维持地方秩序，谕禁所在军民人等勿得借端号召，致滋纷扰。15日，冯国璋以张镇芳、雷震春、》马德麟背叛共和，逆迹昭著，令褫夺官职、勋位、勋章，分交法庭依法惩办。9月26日，大理院判处复辟罪犯张镇芳无期徒刑。11月5日，判处复辟案中之雷震春无期徒刑，冯德麟无罪。
社会各界揭露冯国璋野心并要求严惩祸首。旅沪安徽公民阚钧等通电，反对冯国璋就任代理大总统，略谓冯怀抱野心，欲利