中位置非同一般，自开口岸后，愈发重要，故准备借用南洋水师所裁的“龙骧”等船，用来驻江巡守。
直隶大名府突降冰雹。据本月29日的《大公报》载：大名府本日晚5时，自东北方向风起云飞，雷电交作，倏忽之间冰雹从天而降，冰雹大小有的如核桃，有的如大枣，约10分钟后，平地上的冰雹就积了约有两寸深。冰雹将树叶打落大半，果实全落，庄稼损伤严重，途中行人无处躲避，有的人的头、手被冰雹击破。在大名府的西南隅，冰雹积得更深，至次日午后，背阴之处还没有消融尽净。
9月25日。柯逢时奏请清廷给广西筹拨款项。由于广西地处边陲，起义接连不断，新授广西巡抚柯逢时就准备在他到任后通饬各州县招募团练亲兵，多的可招募300名，最少的也不能下于100名，还准备令各府及直隶州各招募200到300名，均发给兵饷、器械，而这就需要巨额的军饷。综计府、厅、州、县新兵约1.6万名，兵饷、器械及其他需要加在一起，费用约在100万两以上，而广西连年军事不断，粮食歉收，百姓处于水火之中，也需预筹银两加以安抚。故柯逢时奏请俯准每年拨白银，100万两，以二年为期，并请谕饬各疆臣酌量力所能及，借拨部分款项，归于各省所收广西捐输项下，以后陆续归还。清廷饬令户部速议柯逢时所奏请的事宜。
9月26日。清廷饬令各省将军督抚会同商部筹办在各省设立路矿、农务、工艺各项公司。商部奏：“臣部综理商务，拟请设立铁路矿务农务工艺各项公司，业于筹议章程折内详晰具奏。查泰西各国商政，首重设立公司。……惟臣等窃有鳃鳃过虑者，则以管辖之权虽在臣都，而所办农工路矿诸务，无一非地方大吏之责成，如或内外隔阂，未能合力振兴，势将无所措手。相应请旨饬下各省将军督抚，于臣部所设各公司事宜，务须会同筹划，赞助维持，一面严饬各该管道府州县，尽力保护，毋稍漠视。”根据商部此奏请，清廷谕令：“着各省将军督抚，于商部议设各项公司，会同筹划，悉心经理，并饬该管道府州县，随时认真保护，倘有推诿因循，仍前漠视，该部即行据实奏闻，力除壅蔽，毋稍迁就。”
本日清廷谕令，所有路矿事务，归于商部，以专责成，路矿总局即刻裁撤。
清廷谕令军机大臣等，顺天府所设立的工艺局归商部办理。
孙中山为宣传革命、筹措粮饷，于本日离开日本赴檀香山。为能够使其成行，黄宗仰慷慨捐赠银洋200元。
李平书创立医学会。李平书在上海所创立的医学会于本日成立。李平书，初名安曾，字平书，后更名钟珏，字瑟斋。1854年出生于浦东高桥一个医学世家。曾任江南制造局提调，倡导地方自治，热心于公众事业，极受上海民众称道。该医学会的宗旨是贯通中西医学，造福上海民众。该会成立之初，李平书还邀请上海医界名流共同商讨中西医术。会上他向各位到会者介绍了要拟办医学报，编著医学课本，开设养病院及创建医学堂培养医学人才等宏大计划。医学会的成立对中国医疗事业的发展起了一定的促进作用。
浙江宁海大里村发动反教起义。王锡桐名守真，字凤栖，号守曾，浙江宁海县大里村人。出身于小地主家庭，自幼读书，多年科场失意，1898年38岁时才考中秀才。为人正直豪放，好打抱不平。与王锡桐同村的教民王品松夫妇为争轮管祭田一事与其胞叔发生争执，其胞叔王廷锡斥责王品松既然不祭祀祖先，就没有资格管理这份祭田，作为同村人的王锡桐从中加以解劝。王品松夫妇自知理屈，就跑到教堂哭诉，怂恿传教士朱国光出头干预。结果王锡桐无故受辱，从此对天主教痛恨有加，决心“立会招贤”，于是成立了伏虎会，并倡言反教。王锡桐于本日杀死王品松，反教起义自此而始。起义开始后，当地群众纷纷响应，并首先在大里村附近村镇打击教会势力，一些平日作恶多端的教民被处死。
9月27日。清廷以水隆为江宁将军。
9月29日。山西省永济县爆发反对增加柿酒税暴动。数千乡民涌入县城，捣毁衙署，迫使知县承诺停止开征柿酒税。
9月30日。因赈灾需要巨款，山东巡抚周馥奏请“截留积存漕折银两，以资教放”，得到清廷允可。
本月。孙中山在日本与日本平民社领导人幸德秋水就实现社会主义问题交换意见。
孙中山接待来访的留日学生廖仲恺、何香凝等，畅论革命救国的道理和方法。
《铁云藏龟》出版。“抱残守缺斋”于本月刊行了6册石印本《铁云藏龟》，中国第一部甲骨文著录书问世。《铁云藏龟》是刘鹗从他收藏的5000余片甲骨中选录1058片编辑而成的，其中重复出现3片，伪品4片，实收1051片。刘鹗，字铁云，又字公约，别署鸿都百炼生，室名抱残守缺斋。江苏丹徒人。他通算学、乐律、医学等，是中国最早的甲骨文收藏者之一。他不仅在收藏和研究甲骨文方面成绩卓著，而且还积极地向人们介绍甲骨文字，以吸引更多人来研究甲骨文。《铁云藏龟》的出版不仅为人们