田氏土司屈服，丹初如愿以偿，委派矿监，派驻守兵，管理金秀矿藏。
此战，标营以少胜多，轻松取胜，将士信心大增，丹初亦踌躇满志。扩军如此顺利，打土司亦如此轻松，假以时日，天下何事不可为？
他心里冒出了许多想法，想办学校，想办工厂，想收集流民屯田，想鼓励工商，想组建工兵营，想组建匠营……一万年太久，只争朝夕，他真想没日没夜地干，尽快实现这些美好的想法。
然而，二月十六日，焦琏派人送来一封十万火急的密信，打断了丹初的美好憧憬：全州失守，清军逼近桂林！
年前，明军还在全州取得大捷，何以突然失守？说起来，真是令人匪夷所思。
原来满清怀顺王耿仲明在全州战败，很快便得到了恭顺王孔有德的支援。这两人关系很好，在东江镇时还结为兄弟。孔有德已拜为平南大将军，指挥智顺王尚可喜等人，顶住了明军虚张声势的反攻，重新占领了永州。
于此同时，李成栋击败广东诸路义军，再次派出军队攻占广西梧州。
梧州为广西东面门户，全州则为广西北面门户。此时的全州，尚有郝永忠、焦琏、卢鼎、赵印选四镇兵马，由何腾蛟统一节制。
出身于大顺军的南安侯郝永忠，屡受排挤，所部辎重家眷都在桂林。他担心陈邦傅从梧州撤退，会兼并他的老营辎重，未向何腾蛟请示，亦未向友军通报，便擅自从全州撤军，奔回桂林。
何腾蛟成事不足，败事有余，不仅没有制止郝永忠，本人亦率领亲军退还桂林，未向其余三镇通报。
问题就出在这里！其余三镇兵马不知道何腾蛟、郝永忠为何撤军，各自惊疑不定。很快的，赵印选、卢鼎亦撤军，全州只剩焦琏一镇。
全州为焦琏的汛地，焦琏不便撤退。他以平乐为地盘，平乐与全州还隔着桂林。
焦琏亦不敢独守全州，率部还守平乐，委派部将唐文曜、全永总兵王有臣、全永道马鸣銮三人留守全州。
广西北大门全州，原本有数万精兵，顷刻间只剩唐文曜麾下一千八百人马。
唐文曜、王有臣、马鸣銮三人成为弃子，决定投降满清。使者到永州找耿仲明投降，耿仲明还不相信。无奈之下，唐文曜斩杀反对投降的监军周震，取首级作投名状。
耿仲明欣喜若狂，派两千骑兵重新接管全州。
何腾蛟大惊失色，率领亲军驻守兴安，又檄令赵印选、郝永忠、焦琏派兵增援。焦琏已经还守平乐，来不及救援，清军已经突破严关，在兴安屠城。
何腾蛟在御滇营骁将胡一青的保护下突出重围，郝永忠所派一千骑兵无一幸免，全部战死。
兴安一破，桂林只剩灵川一道屏障，由郝永忠负责防卫。
焦琏闻警，立即率部星夜急进，增援桂林，又檄调各部兵马，迅速驰援桂林……
此事体大，丹初立即召见诸将集议。
看过书信，诸将面面相觑。匡时打破沉默，率先问道：“爵帅在信中语焉不详，桂林情况究竟如何，皇上銮驾安在，全都不明不白。”
问题就出在这里。或许，焦琏也不清楚桂林的情况。或许，他为人粗疏，忘了交待明白。
丹初意识到，自己已是总兵官，必须清楚地掌握敌情，随时关注时局的变化。若说建立情报网，似乎力有不逮，但最起码，要往桂林、梧州委派斥候，随时传送情报。
嗯，大敌当前，时局正在恶化，更应该加速建设情报网。
丹初不动声色，说道：“看爵帅的语气，情形很坏，桂林已经危在旦夕。至于銮驾，应当还在桂林。我已决定率军增援桂林，明日拔营。今日集议，便是想询问一下诸位，明日出征，有无困难？”
值此场合，当然没人示弱。否则，他的能力就会受到置疑。这对武将来说，后果是极为严重的。
“很好，”丹初很欣慰，说道：“时间紧迫，我就不一一征求意见，直接开始部署了。”
主帅与武将大不相同，必须统揽全局，考虑问题必须面面俱到。丹初第一次组织全军行动，考虑问题还算全面，指挥部署可圈可点：
此次出征桂林，动用标营、中军、步兵一营、步兵二营，共约一千八百人马。标营为先锋，由丹初亲自率领。中军、步一营、步二营由右参军方以智节制，继标营之后。
全军皆走陆路，经修仁、荔浦、平乐、阳朔至桂林，全程不到三百里，预计将在二月二十三日抵达桂林。
左参军俞厚基留守永安，小事自决，大事与瞿夫人商量办理。守营三百人马皆为守城兵，留下防卫永安。
打仗不难，难在后勤。丹初并不指望瞿式耜、何腾蛟能为他供应粮草弹药，尽量立足自身供应粮草。
以永安州尚在的钱粮，支撑这次战斗应无问题。关键是，要把粮草辎重及时送到前线，还不能被友军劫掠。
丹初决定在昭平、平乐两地设立粮台。运粮路线与行军路线不同，先从永安至昭平走陆路，大约八十多里，再在昭平改走水路，溯漓江而上。
依靠大车走陆路运粮，效率极低，常常耽误战事。明军在萨尔浒之战、松锦大战中，屡