日军125侦查潜艇失踪的情况，被位于澎湖中线海域的日军141侦查潜艇获悉后。该艇日军艇长不敢冒险，下令潜艇一面观察敌军船队动向，一面向澎湖反向撤退，同时保持距离随时向台北司令部报告。
两艘日军袖珍潜艇接到拦截命令后，以攻击队形迎战。两名袖珍潜艇艇长决定在水面迎敌，发射完鱼雷后便于快速逃跑。水下发射虽然可以做到隐蔽、安全，但是鱼雷舱由于高压气体的原因，海水会进入继而形成大量气泡。
气泡会持续几分钟，如此很容易暴露潜艇的位置。况且潜艇在水下航行速度只能达到8节，在加上气泡暴露位置，会遭到敌方精确攻击。两名日军艇长发现，冲在前面的渔船恒速很快，说明敌人渔船安装了机器，机动能力很强。八路军猎潜大队的渔船，吨位基本上在80吨左右，每艘猎潜渔船搭载12枚深水炸弹，每支猎潜分队定员为8人。两名轮机兵、一名分队长、一名电报员、一名声纳兵、三名操作手。
猎潜大队12艘猎潜木船呈一字型，在船队前面乘风破浪，气势蔚为壮观。猎潜木船上的声纳系统非常简单，机器设备是从美国运来的，由八路军福州海军研究所设计组装。这套声纳系统仅在船头安装一个探测点，探测距离为20海里。声纳显示屏就在甲板上，靠近分队长的位置。此外，木船甲板上还有一支迫击炮分队，有4门迫击炮8名炮手，整个猎潜木船上人员共16人。“报告大队长，2点钟方向发现日军潜艇！”声纳兵急报。
也许大队长作战经验欠缺，也许是第一次参加战斗，此时大队长格外紧张。第2猎潜分队大队长叫林水生，曾在红星舰队炮舰上担任过水兵。八路军猎潜大队是去年中旬组建的，就是为台海战役量身定做。猎潜大队有4支，此番第1、2猎潜大队率先出击，第3、4猎潜大队分别在福州、泉州港口待命。面对日军的潜艇，林水声举着望远镜的手有些颤抖，属下也是格外紧张。“两点钟方向发现两艘日军潜艇，命令各船迫击炮准备，进入射程立即展开攻击，干扰日军潜艇发射鱼雷！”
林永生尽管紧张，可是头脑依然保持清醒。不久，各船参差不齐的炮声盖过机器的轰鸣，炮弹在日军潜艇周围爆炸，命中率不高。日军潜艇乘员没有想到对方有迫击炮，袖珍潜艇被迫击炮弹击中同样是致命的。虽然对方的迫击炮命中率不高，但是不得不防。日军艇员立即操作潜艇下潜，不到一分钟日军袖珍潜艇便淹没在海里。海面上失去目标，炮击炮停止射击。“报告大队长，日军潜艇没有逃跑，并进入攻击状态。”“命令各船高度警觉，日军潜艇要发射鱼雷了！”
鱼雷对大型战舰攻击效率佳，原因是大型战舰笨拙，尤其是在海里的灵活性如同老牛拉车慢吞吞。此外鱼雷也是为攻击大型战舰量身定做的，攻击小型战舰尤其是小型炮舰，在对方有准备的情况下，击中对方的概率几乎微乎其微。猎潜木船吨位只有80吨而且是机帆船，躲避日军潜艇发射的鱼雷，在灵活机动性方面占有绝对优势。进入鱼雷射程，两艘日军潜艇瞄准目标一口气发射了4枚鱼雷，鱼雷贴着海面高速而来。
按照平时训练要求，躲避鱼雷在时间反应上、以及机帆船的机动性能方面没有任何问题，可是猎潜大队水兵根本没有实战经验，由于12艘猎潜木船相隔距离太近，再加上紧张操作出现失误，恐怕的场面接踵而来。林水生的指挥船位于中部突前，第一枚鱼雷目标自然对准他。情况万分危急，关键时刻林水生反而冷静，大声指挥轮机手躲避，轮机手手忙脚乱总算没有失误，只见鱼雷犹如一头凶猛的鲨鱼，贴着右侧船舷划过。
然而，林水生的运气是正确应对，才躲避了致命一击。此时左侧一艘木船躲避不及被被击中，伴随一声惊天动地的爆炸，木船被炸的四分五烈，碎片在空中飞舞。如此猛烈的爆炸，船上的人生存的希望几乎为零。间隔几十秒后，右侧一艘木船也被击中，爆炸的恐惧震撼、硝烟笼罩。日军潜艇乘员在潜望镜里，见证了震撼的场面，欣喜若狂从容撤退。日军艇员没有选择深浅躲避，而是潜望镜露在外面逃到安全区域再浮出水面全速撤退。
两艘猎潜木船被击毁，如此猛烈的爆炸，反而激起了水兵的斗志。大队长林水声心里非常清楚，爆炸的烈度可说明一切，船上的人全部阵亡。带着满腔怒火，他命令绝不放过日军潜艇。日军袖珍潜艇在水下航行速度只有八节，而猎潜木船的航速达到28节，日军潜艇想逃是不可能的。日军艇员没有想到敌方木船有声纳系统，可是当敌船四面八方准确的围上来，他们才意识到木船上安装了声纳系统，否则不可能如此精确找到目标。如此重要的信息必须向上面汇报，况且潜艇在水里，敌船的迫击炮奈何不了自己。
日军艇员从容的发报，发完电报他们在潜望镜里发现了可怕的东西，敌船上有深水炸弹。这一发现让日军艇员十分恐慌，立即选择深潜躲避。海面上出现的气泡，显示出潜艇准确的位置，还犹豫什么哪？日军袖珍潜艇正在下潜之时，4枚深水炸弹垂直追击，毫无疑问，爆炸的冲击波让两艘日军袖珍潜艇葬身海底。油污在海