人为的麦田圈大多制作得非常粗糙。如图是2007年8月1日麦田圈与2013年7月6日人为仿制的圈的对比。
在很多麦田圈里，麦秆折弯处会出现节点，是结构改变导致弯曲，且弯曲后作物还能正常生长。人为用木板压制麦田圈的方法无法产生这一现象。
很多麦田圈当年对土壤产生了某些深层次的影响，从而对第二年该麦田区域的作物生长继续产生影响，以至于在航拍或卫星拍摄时可以看出部分麦田圈轮廓，这一现象被称为“幽灵麦田圈”，这也是人类所办不到的。
在极端天气下也有可能出现麦田圈。2013年7月29日，荷兰stadskanaal下了一夜的雷雨，头一天傍晚klundert夫人在麦田对面的一个公寓楼里拍摄了一张照片。第二天雨过天晴，她就发现那个地方有几个麦田圈在那里，于是又拍摄了一张。
此外，描绘外星人外形的麦田圈也不少。其中最复杂的当属2002年8月15日在阿雷西博天文台附近出现的一个麦田圈。该麦田圈倒伏的麦子分很多高度，有从根部弯折的，也有从中间弯折的，也有从头部弯折的，这样构成了深深浅浅的明暗色阶，人力几乎无法完成。
至于外星人如何制造麦田圈，主要有两种说法：一种说法是，麦田圈是“印”上去的，如图是打偏了的麦田圈；另一种说法是，制作者是有智慧的，而不是智能机器。他们用“带状飞镖”制作麦田圈，如图“辅助线”支持这种说法。
典型的麦田圈，完全没有破坏痕迹，麦秆丝毫无损地在被压下而改变方向（并非践踏或机械屈曲而成），麦田圈和周围的土地上有一些人眼无法看到的磁性小粒，分布均匀，离怪圈越远颗粒越少；麦秆像分层编织：顺或逆时计针方向间隔倒下，有时多至五层，但每粒谷仍像精致安排的一般秩序井然；图形以精确的计算绘画；无论图形多么复杂、工程多么浩大，它们都是一夜造就；并且，形成过程无人目击。
也有人认为，麦田圈只是一种自然现象，成因还未被人类发现。就像雷电，古时候人类也是以为是雷神电母做的。
对于麦田圈中经常出现人文信息的现象，他们认为这只是人们“先入为主”造成的错觉。
龙卷风说
从有关记载来看，麦田怪圈出现最多的季节是在夏天，有人认为，夏季天气变化无常，龙卷风是造成怪圈的主要原因。很多麦田怪圈出现在山边或离山六七公里的地方，这种地方很容易形成龙卷风。也有气象学家提出：大量尘埃包含在陆地上生成的小型龙卷风中，在风的作用下，尘埃与空气剧烈摩擦产生静电荷。神秘怪圈就是在带有静电荷的小型龙卷风的作用下产生的。
磁场说
有专家认为，磁场中有一种神奇的移动力，可产生一股电流，使农作物“平躺”在地面上。美国专家杰弗里·威尔逊研究了130多个麦田怪圈，发现90%的怪圈附近都有连接高压电线的变压器，方圆270米内都有一个水池。由于接受灌溉，麦田底部的土壤释放出的离子会产生负电，与高压电线相连的变压器则产生正电，负电和正电碰撞后会产生电磁能，从而击倒小麦形成怪圈。
预告说
一些人相信，麦田怪圈背后有种神秘的力量，就像百慕大三角一样。根据这种猜测，有人认为麦田怪圈是“灾难预告”。
高频辐射说
俄地质协会成员斯米尔诺夫决意解开此谜。斯米尔诺夫从麦田里捡了一些荞麦秆，并把它们带回自己的实验室。他把荞麦秆放进微波炉里，然后加入一杯水，在600瓦的高频辐射下，经过12秒钟，荞麦秆发生了奇异的变化，所有试验的麦秆都在节瘤处发生了弯曲，其形状与陶里亚蒂麦田里倒伏的麦秆完全一样。斯米尔诺夫因此得出推断，陶里亚蒂的麦田一定是受到了高频辐射，但哪儿来的高频辐射呢？斯米尔诺夫认为，也许来自地球内部的磁场变化。
俄电工学院的专家阿尔将耶夫的观点与斯米尔诺夫正好相反，他认为高频辐射来自闪电。阿尔将耶夫称，高频辐射使草本植物发生规律性倒伏并不稀罕，50年前他们就在学院的草坪上干过这事。当年，阿尔将耶夫与两名年轻的助手一起在学院的草坪上试验高频设备，当悬在草坪上的高压电缆被接通时，电缆下方的草坪立刻呈顺时针方向倒下，形成一个极其规律的圆圈。阿尔将耶夫解释说，当电缆通电时，草坪被电磁化，此时的草坪相当于电机里的定子，而电缆是转子，在电磁扭力的作用下，草坪上的草便发生扭曲。阿尔将耶夫认为，电缆所产生的电磁现象相当于人造闪电，而大自然的闪电更加奇妙，它会产生更加复杂的电磁场，因而也就可以画出更加奇妙的图案。
关于麦圈这一神秘现象的形成，阿尔将耶夫与斯米尔诺夫两位学者的观点似乎都很有说服力，不过，就算麦圈是高频辐射现象所为，但两人都没有证实，高频辐射来自哪里，是地磁现象？还是天空闪电？
1外太空粒子束或能量束击打造成。大自然是鬼斧神工的最大制造者，在短时间