军委会之外特设内务部，内务部下设两部门，分别为：第一总局和第二总局。第一总局是对外情报侦察部门，对保安团辖区外情报侦察和渗透，重点工作对象为：中国各军阀，国府，共党，日本（重中之重），该部门被称为第一总局这一事实，也强调了对外敌人斗争的头等重要意义。
第二总局则从事内部反间谍情报侦察工作，对辖区内所有公民实施“全面监视”，保证军队、百姓乃至内务部本身的安全；同在辖区内开展反间谍斗争，制止外国特工机关对辖区的渗透和破坏，保卫辖区桥梁道路及工业设施安全，保证辖区安定，同时领导有关军事部门和部队的特别勤务处的工作。
两总局一内一外，相互配合构建全面密致的情报网络，内务部直接隶属陈科本人，只对陈科一人负责，保证陈科对军队及辖区的绝对控制。
除设立军委会和内务部，陈科再次申加强部队思想政治工作的重要性，陈科提议建立政委制，在排级及以上单位设立政治委员，政治委员与同级军事主官同为所在部队的首长，政治委员负责部队内政，军事主官负责军事指挥，两者互不统属，互不干涉，但同时政治委员拥有对军事主官的监督权，类似于古代的监军。
会议上军官培训被正式提上议事日程，随着保安团队伍的扩大，军官的缺乏及现役军官指挥才能不足已经严重制约保安团实力的提提升，创建军校、培训军官已到刻不容缓的地步。当然保安团不仅仅缺军事类干部，政工类干部同样严重不足，保安团实际辖区内政权组织至今未能建立和有效运转。
此外像部队整编，炮兵、防空兵、通讯兵、坦克兵等技术兵种的培养，会议上统统涉及，保安团实际控制区的政权构建，纳入规划蓝图，保安团将组织专人对控制区人口、资源进行大规模普查，建立健全户籍制度，为县级政权建立奠基。
陈科提出的一系列部门及制度建设，除了政治委员制度其它都顺利通过，对于政治委员制度则产生部分分歧。
朱镇坚决反对在保安团实行政治委员制度，原因很简单，政治委员制度实在太敏感，容易被人联想到陕北的那支军队，保安团的“三查”和“诉苦”已经有通共之嫌，要是再弄出个政治委员制度，还不直接被扣上GD军队的帽子！
不论是国府还是韩复渠对GD都是相当提防，一旦被扣上GD的帽子，那处境将极为艰难。
朱镇的反对引起陈科的高度重视，对此事陈科还真是百密一疏，陈科光想着提高部队凝聚力，忽略其它因素。朱镇的反对令陈科恍然大悟，政治委员制度太敏感，大不了给它改头换面包装一下。
陈科沉吟片刻，大脑快速运转，消耗智商五点，一个经过华丽包装的新式机构新鲜出炉，政治委员制度这个名字不能用，那就改成内务委员，嗯，按字面意思解释，负责部队内勤。总之一句话，换汤不换药，不论名称怎么变，其实质不变。
此次会议规模虽小，却意义深刻、影响深远，军委会及内务部的成立，实事上确立陈科对部队的绝对控制，除此之外，创建军校、清查户籍、政权构建为保安团扩编打下坚实基础。
会议结束后，陈科回到卧室，立即登录系统，直接进入奖励模块。奖励模块上方绿色数字“5”异常的醒目，五次抽奖机会，陈科毫不犹豫说道：“开始抽奖，抽检分项：基础设施建设。”
陈科话音刚落大屏幕上就出现了一个大转盘，基础设施建设模块的奖品出现在大转盘上，大转盘上的指针飞快的转动着。
“停！”陈科喊了一声，指针最终慢悠悠的停在隧道建设令，“**，白白浪费一次机会！”陈科懊恼的说道。
“接着抽！”
大转盘上的指针再次飞快的转动起来，“停！”陈科一声令下，指针速度骤减，依靠惯性缓缓的在大转盘转动，陈科紧紧地注视着缓慢转动的指针，嘴里喃喃自语道：“军校，军校！”
似乎系统听到了陈科的心声，指针缓缓停在“军校建设令”的边缘，仅仅一丝就跳转下一格，见此情景陈科紧绷的心弦一松，不由长出一口气，内心大呼侥幸，“好险，就差一点点。”
但是系统事情真的会一帆风顺如陈科愿吗？呵呵，显然陈科高兴的太早，“格！”就在陈科庆幸之时，指针轻微一阵，竟然滑向下一格“船坞码头建设令”。
见此情形，陈科彻底傻了，真的是欲哭无泪，这尼玛结局也太富戏剧性了。陈科发出愤怒的咆哮：“啊！破系统，不带这样玩大爷的！”
半响陈科才强迫自己冷静下来，咬牙切齿的说道：“接着抽！。”这一次依旧没有抽中“军校建设令”，反而再一次抽到要塞建设令。
一想到白白浪费三次抽奖机会，陈科心痛的滴血，“再抽！”陈科偏不信邪，再次抽检，一副不抽到“军校建设令”誓不罢休的模样。
“哈哈哈，中了，终于抽到了。”第四次抽奖，没有让陈科失望，终于抽到“军校建设令，陈科不禁喜上心头，激动的泪流满面，不容易啊！“历尽艰辛”终于达成