。等阿土怒反应过来后，整个国家已经即将崩溃。只有几个比较偏僻的城市幸免于难，这些偏僻的城市因为距离比较远所以暂时没有收到攻击，不代表就不会收到攻击。于是这些幸免于难的阿土怒人开始考虑离开，由于被超级蜥蜴袭击的都是科技超级发达的城市，这些偏僻的小城没有过多的星际运输攻击，只能凭借博物馆里面老掉牙的星际工具还是外逃。
阿土怒几乎一夜间被灭导致了另外二个国家的警惕，其中一个国家就是亚特兰蒂斯，另一个国家叫玛雅。
玛雅是第二个被攻击的国家，在超级蜥蜴攻击的时候玛雅人已经做好准备。第一次攻击超级蜥蜴没有沾到多少便宜，在玛雅人拼死抗击下，超级蜥蜴被打退。但玛雅损失惨重，所有的超级武器都被超级蜥蜴消灭，只剩下一些对超级蜥蜴没有任何影响的单兵武器。最后城邦都被损坏，虽然玛雅人还有不少，但是千疮百孔的玛雅国加上各种辐射造成的污染已经不适合再居住。于是玛雅人决定离开世代生存的火星，开始漫长的星际流浪生活。
亚特兰蒂斯见前2个国家都被超级蜥蜴所消灭，由于战争导致整个星球已经不再适合火星人居住了，在国会的决定下，亚特兰蒂斯准备启动第二星球方案，第二星球就是地球。当时亚特兰蒂斯人决定留下大部分人跟超级蜥蜴决战，还有一部分人撤退到地球，以谋求什么时候东山再起。
留守的亚特兰蒂斯人聚拢了当时还在火星上所有的火星人，准备做最后抵抗。这个战争一直打了几十年，最后火星上所有物种都在亚特兰蒂斯的召集下共同对抗超级蜥蜴。火星的超级蜥蜴在这场战争中也是精疲力尽，但是为了以后种族的正常繁衍，他也不得不进行对抗。这场战争不管谁胜利，失败着唯一的下场就是灭族。
战争打到这个程度谁都不可能退出，最后亚特兰蒂斯留守的最高长官看这样下去实在是无法胜利，好在他们已经做了后续安排，于是准备冒天下大不为准备动用中子弹，这是一个可以轻易消灭一个星球的超级超级武器。准备跟超级蜥蜴及火星同归于尽。
超级蜥蜴明显感觉到了这个武器的威力，在万分无奈下布下了灭绝大阵。这个大阵一旦启动，除了火星蜥蜴这个种群外，所有生物都会被消灭。灭绝大阵在亚特兰蒂斯的中子弹发动前发动了，整个火星的生命体都被这个阵法消灭，包括亚特兰蒂斯人，阿土怒人，玛雅人及火星上其他种族跟生命。
超级蜥蜴因为布置这个灭绝大阵元气大伤，再也无力去追逐已经逃出火星的火星人。阿土怒人最后的去向不明，玛雅人有一部分因为星际飞船故障不能远距离航行去向了地球，亚特兰蒂斯人则在地球建立了新的国度。