《苏报》发表陈天华《论中国学生同盟会之发起》一文。为支持邹容倡议成立中国学生同盟会，陈天华在《苏报》发表《论中国学生同盟会之发起》。略谓：“蜀邹容者，东京退学生……毅然创一中国学生同盟会，……其目的在于学界成一绝大学会团体，以鏖战于中国前途竞争逼拶之中者也……惟兴惟亡，是在汝！是在汝！”
《绣像小说》在上海问世。《绣像小说》为国内首份文学半月刊，由李宝嘉主编，商务印书馆发行。该刊的宗旨在于运用文学的通俗性开发民智，宣传爱国，从而达到除弊兴利，国家富强。其作品内容广泛，有反映维新运动和立宪运动的，有揭露清朝官场黑暗及列强侵略活动的，也有通过翻译作品传播西方资产阶级文化的，另外对工商活动、教育改良、改革风俗等也都有所涉及，无一不是有关社会大事。该刊出版发行后，极受欢迎，甚至还远销日本、新加坡等地。它与《新小说》、《月月小说》和《小说林》并列为中国四大权威文艺期刊。
6月1日。《苏报》于本日刊登《驳康有为书》一文，对保皇言论严加驳斥。
魏光焘等将征收屯田税饷四条章程上奏清廷。清廷曾一再谕令各省督抚清查屯田地亩，遵旨办理之后，两江总督魏光焘等将办理情形以及会商议订的四条章程举奏给朝廷，他奏道：“现据江宁布政使李有菜、江苏粮道胡延会详称，查江省所属各卫，除江淮、兴武二卫向无屯田不计外，所有淮安、大河、扬州、徐州等四卫屯田，当经通饬自光绪二十九年起，分劈坐落各州县接收查办。谨将一切办法会议章程四条：
（一）缴价宜酌分等则也。
查江省淮徐等四卫屯田，共计一万一千六百二十一顷有奇，各丁私相典卖，纠葛甚多，且嵌坐各州县境内，与民田犬牙相错，田地肥瘠不同，价值多寡不一。兹就各属禀报情形，酌中核定，按照各卫额设顷亩，无论军执民执，每亩缴价，上则田三两，中则田二两，下则田一两，由屯坐州县先行出示晓谕。屯田具报承执顷亩各数，并历年征收册串花名，照章勒限催缴，不准避重就轻，倘有隐匿逾限不报，查出即行招买变价充公。
（二）纳税宜量予限制也。查民间置买田地，例应价银一两，完税银三分，今屯田纳税，自应仿照办理。俟各属造送花户顷亩册后，由道刊刻印照，编立字样，发由屯坐州县，按照册内花名及承执顷亩数目，应缴价银若干，税银若干，逐一注明照内，粘贴藩司契尾，发给业户收执管业。所有价银税银，均一律缴解司库兑收，专款存储，听候拨用。
（三）屯饷宜照旧征解也。查江省淮大等四卫应征屯折漕粮等款科则，轻重不同，而编征款目，均系查照赋役全书及部颁定额，征解司道各库兑收，相沿已久，今若改照民赋，未免纷更烦扰，诚恐于原额饷项有亏，应请仍照旧制征收，分解司道各库兑收造报，庶几民不扰而赋有常。
（四）运田宜征收粮赋也。查扬州卫仪征帮及兴化所有运田一项，从前起运之年，给丁济运，并不征粮。今既删除运丁名目，将屯饷改为丁粮，此项运田，应请一律造串启征粮赋。复查安徽省泗州卫，向有运津一款，征解道库，所有仪征运田、兴化军田以及各帮无主绝军之田，似应查照泗州卫征津章程，由嵌坐各州县，就近体查情形，详定科则，征收运津银两，推解道库兑收造报，俾免隐漏。”
商约大臣吕海寰致函江苏巡抚恩寿，声称上海租界有人在张园聚众议事，要求将为首者设法密拿严办。
6月2日。清廷给山东河工拨款。应山东巡抚周馥奏请，清廷让户部拨给山东河工白银300万两。河工约需500万两，其余的200万两，令其在本省内筹拨。
6月3日。英印总督寇松派人强行进入西藏干坝地区。本日，英印总督寇松以谈判为名，派怀特、荣赫鹏为代表，率领卫队200余人和输送队300余人，强行侵入干坝地区，开始了英国继1902年6月作为第一步的武装侵略西藏战争的又一个阶段。
《苏报》刊登章太炎所著《客民篇》一文，斥清廷为“客帝”。
6月4日。清廷命户部右侍郎铁良会同直隶总督袁世凯办理京旗练兵事宜。
清廷以礼部左侍郎特图慎兼署户部右侍郎，兼管钱法堂事务。
黄兴等人接受军国民教育会的派遣，起程回国策动革命。
驻美俄使向美国国务卿海约翰声明，俄国并不反对满洲开商埠。
6月5日。《苏报》刊载清廷严拿留学生的密谕。本日《苏报》将清廷严拿留学生的密谕予以公开发表。该报在谈到密谕由来时，说是由密友访来。该密谕历数了朝廷对待士人的深仁厚泽，对于那些革命党做出有负于国家之事表示难以理解。在谈到日本留学生时，密谕中提出，“前已饬蔡钧、汪大燮于在日本东京留学生举动，务加详察。各直省地方官，于日本游学生之返国者，亦暗为防堵，遍布耳目。昨据袁世凯密折，内言东京留学生蓝天蔚等各若干人，编集数军，希图革命。其电该督臣之意，又有诡言俄患日深，求该督助其军火，