津道台在咸水沽和大沽等地先后设税所收税，要求总税务司结束这种重征税收的混乱状态。
9月15日。赫德通知各使馆由天津运京的食用物品免征进市税。9月19日。天津临时政府账户已经结束，其后常关由津海关管辖。
杭州关实施《续改内港行轮章程》，共10款。杭州关制定《杭州关公事房办事细则》，对检查船舶、货物，征收税费，单证传递等方面，都做了具体规定。
10月7日。总税务司命令：秦皇岛关与山海关港口及沿海灯光设施的管理与维修，立即由东海关税务司公署移交津海关税务司公署。
10月8日。清政府与日本签订《中日通商行船续约》，确定“中国允愿俟中日通商行船条约批准互换六个月内，将长沙府辟作通商口岸”。
10月14日。总税务司就新订进口税则事奉外务部札，通令各关税务司，新税则自本年10月31日起生效。
10月20日。两广总督命令：鉴于省内旱情严重，晚稻失收，禁止大米、稻谷出口。是年征收谷仓捐12500银两。
10月31日。津海关公布修订海关进口税则。
10月。金陵关前江岸因受江水激冲坍塌，陷入江中数十丈。
12月17日。京师大学堂开学。同文馆于年初并入。
12月23日。英、美两国私相授受，将毗邻英租界之美国租界地131亩并入英租界，津海关道发布告予以承认，使英租界总面积达6149亩。
12月。经驻重庆各条约国领事同意，重庆关颁布《重庆关理船章程》（二十九条），该章程共分“停泊界限”、“军火”、“装油船”“传染疾病”、“保护水道”、“杂项”等6个部分，对进出重庆港的船舶及有关事项做了详细的规定。
是年底。岳州关正式成立巡江事务段，巡江司由总税务司任命，业务归属总税务司署船钞部。
是年。漳州邮政分局、石码代办所并入厦门邮政总局；海关对通商口岸寄发或投递的邮包进行监管（1903年，增设泉州府邮政分局和安海、惠安两个代办所）。
浙海关将50里内常关经费裁减一半，并减少常关人员。
大连港正式开港使用。本年度到港船舶717艘次，登记吨位29万吨，其中俄国324艘次，日本241艘次；帆船1418只。货物吞吐量约42．3万吨，大部为进口货物。旅客流量54134人次，大都来自日本和俄国。至日本、朝鲜和欧洲有定期航船，由俄国义勇舰队独自经营。旅顺港本年度到港商船677艘次，进口货物29万吨。
东清铁路南港支线全线开通。
奥国驻津副领事贝瑙尔与津海关道唐绍仪等在天津签订了《天津奥国租界章程合同》，把位于海河东岸临近意租界的面积为1030亩的土地划为奥租界。
南京商埠局成立，专管理外商，海关监督任局长，税务司协同办理。
沙俄政府未经中国政府同意，擅自在满洲里设立了俄国海关，检查输出、输入俄国的货物和物品，按俄国税关规定征收关税。
法国在越南河内举办国际博览会，外务部令总税务司备办物品，并派税务司前往。
清政府商约大臣吕海寰、盛宣怀与英国修约专使马凯（JLMackay）在上海议定，安庆允开口岸，外国商船取得芜湖海关所发内河专照（RiverPass），便可来往安庆通商。
中国在不平等条约制约下第二次修改海关税则，各海关较长时期内执行此税则。
江汉关开始检疫，制订检疫规则。
四川省实行禁烟，使重庆关从1902～1911年10年间的海关税收锐减，海关税收的重要来源烟土税几乎等于零。
本年度各关税收共计30007043海关两，其中进口税10850429海关两，出口税8955131海关两，复进口税1535333海关两，药土税2090657海关两，船钞920911海关两，内地子口税1553779海关两，洋药厘金4100803海关两。