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9月5日。日俄签订《朴茨茅斯条约）。
9月7日。关东州民政署公布军令，允许一般商人及船舶自由出入大连湾沿岸诸港。
9月12日。总税务司接奉外务部札，通令各关税务司，今后在国外承办博览会改由商部主办。
9月13日。美国铁路大王哈里曼从日本横滨乘美国籍客船到大连。这是日俄战争爆发后，除日本船以外到大连的第一艘外国船。
9月20日。总税务司任命李蔚良（W.C.Lay）、嘉兰贝分别为粤海关、江海关邮政司，专司邮政事务。
9月22日。清政府核准，镇江关海州大浦港自行开埠，进出船只和货物按《内港行轮章程》管理。
9月。以“滇督奏准自行开放”的形式，昆明辟为商埠。10月4日。总税务司通令：铜币由天津出口必须有省政府的证明文件始可放行，光铜币严格禁止进口。
10月23日。总税务司第1291号通令：暂停禁止进口吗啡。
10月24日。经拱北关税务司批准的澳门至南莨客货渡船，是日起开航。该航班进出澳门经马骝洲分卡，办理报关查验海关手续。11月29日，该班渡船停航。
10月。赫德与德国驻华公使穆默（P.A.Mumm#v0n#Schwarzenstein）讨论如何为海关设立免税区问题。
11月6日。总税务司第1294号通令：为规范关员行为准则事。
11月7日。江门关在珠江口内横门设置一个6级蔽式助航灯，名为横门口航灯。
11月16日。津海关税务司德璀琳由欧洲返津。
12月1日。德国人阿理文重回胶海关任职。同日，胶海关撤销胶济铁路各车站的海关办事处。同日，总税务司修订《青岛设关征税修改办法》和《青岛德境以内征税办法章程》。
12月22日。由日本外务大臣小村寿太郎与清政府外务部总理大臣奕在北京签订《中日会议东三省事宜条约》。主要内容：清政府承认《日俄朴茨茅斯条约》中俄国将旅大租借地、长春到旅顺间的铁路及其支线以及与租借地、铁路相关的一切权利（包括设关权）移让给日本。自此，日本势力侵入中国东北地区。是年。德国筑港工程师维林（青岛港工程设计师）对东海关所辖烟台海坝工程提供设计方案，并开始填海施工。
东海关建成烟台山灯塔，水平线至灯光中心线高度为175英尺。（该灯塔于1980年被烟台港务局拆除，改建新灯塔，改称崆峒岛灯塔，于1988年10月1日正式发光。）
东海关在胶州、济南分别设邮政总局，开办邮政业务。
两广总督岑春煊兼管粤海关，其官衔全称是“钦命头品顶戴紫禁城骑马赏穿黄马褂兵部尚书署理两广总督部堂兼管粤海太平两关税务”。此后至1913年5月，均由地方官员兼管粤海关，不设专职监督。
厦门邮政总局开办快信业务。
浙海关邮局挨次扩充，寄信者日多。邮局汇票一项，为市民所赞许。
金陵关商埠局设立浦口分所。
镇迪道中俄通商局与俄驻迪化总领事议定：在缴纳牲畜交易税后，准俄商在镇迪道属境内贩卖牲畜：牲畜交易税以交易额计算，收税标准为每银两抽收3分。具体税额为：俄商买羊一只纳税6分，牛、马每银两纳税3分；卖羊一只纳税3分，牛、马每头匹纳税3钱。即使如此低税率，俄商仍拒缴，软弱的清政府也只好在宣统元年（1908年）6月1日饬令新疆暂从缓议征俄商牲税。
金登干为赫德处理不动产问题以及赫德私生子企图敲诈问题：他与赫德的代理人和律师商讨这些问题。
广东省督宪札委廉州知府高觐昌兼任北海常关委员。
梧州关向怡和洋行购置房地产作税务司公馆。
日本大阪——基隆——北海的海运航线开通。
重庆关税务司公署由朝天门糖帮公所迁到太平门顾城街。
本年度各关税收共计35111004海关两，其中进口税13778705海关两，出口税9491269海关两，复进口税1844030海关两，药土税2703186海关两，船钞1105350海关两，内地子口税2034408海关两，洋药厘金4154057海关两。