颁布（港湾出入船舶管理规则》。日本政府允许普通日本人自由航渡移居大连地区。
9月20日光绪皇帝下令：严禁鸦片种植、吸食与销运，10年内彻底禁绝：全国各地开展禁烟活动：为此，九龙关与香港政府商定，逐年递减鸦片进口；每年进口数量由海关核定，凭海关发票报关进口，预定于1916年完全禁止进口。
9月22日。总税务司第1369号通令：设立税务处不影响总税务司署与各口海关之关系，并澄清各种谣传。
9月29日。台风袭击澳门，拱北关财产受到严重损失。前山、三厂、炮台山的关员宿舍半数倒塌。巡逻岗哨全被一扫而光，东澳分卡办公室和宿舍严重破坏。
9月。闽海关监督辖下关务处设立，厦门相应设关务分处，厦门关银号改归厦门关务分处管理。
10月1日。崖门分卡由拱北关移交江门关管辖。
广东水陆巡防营务处兼缉捕总局函告九龙关，孙文由法、日运大批军火到港澳，请予严缉。
10月2日。日本内阁再次就“外国人及外国船只进出大连的管理”问题进行讨论，并决定“吨税、引水费、码头栈桥费”等，由关东都督征收。
10月11日，两广总督岑春煊又函告九龙关，孙文“屡谋不轨”，要严加防范。九龙关为此加强对武器的查缉。
10月20日。总税务司发布通令：民局交由大清邮政局代寄的总包自1906年11月16日起半价收费。
10月30日。总税务司第1381号通令：重申海关总税务司改隶税务处，其办事程序与关务关系一如既往，并无改变。
11月6日。清政府邮传部成立。
12月3日。总税务司第1389号通令：为税务处指派委员巡查各常关应予协助。
12月8日。总税务司第1393号通令：转饬税务处接奉上谕，痛斥吸食鸦片恶习，转发严禁吸食鸦片与禁种罂粟章程。
12月9日。清政府改督办政务处为会议政务处。
12月13日。海关总税务司署规定，秦皇岛关税收同津海关分开上报。
拱北关稽查员阿西斯和一名关中头目梁胜因在前山抓获两名海盗，受到广东水师提督衙门的奖励，各人都奖五品的军功、顶戴和宪牌。
12月15日。赫德与日本驻华公使林权助（TadasuHayashi）就设立大连关及将东北分成4个关问题达成协议。
12月18日。台风袭击烟台港东海关码头，验货场和办公生活用房屋损失严重。
是年潮海关税务司师范西（P·J·Smith，英籍）与两广总督岑春煊联系密切，反对孙中山的民主革命。岑多次下令严禁军火进口，并发下密电码一本。潮海关税务司曾向岑密报黄岗起义及清军镇压等情况。
意大利政府授予赫德皇冠大十字勋章；日本政府授予他一等旭日勋章。
尽管金登干的健康非常糟糕，但他还不停地为赫德处理各种问题。
烟台港进出船只5775艘次，其中英国船1957艘次，达到开埠以来最高数量。
江汉关在九江设立巡江司，专司测量水道、检查沿江标志事宜。北京总税务司署任命奚理满船长为巡江事务长。至此，航行标志的设置才发展到长江中游（汉口至宜昌）。
东兴附近开采锑矿，同年有2010担从北海出口，1907年始停止开采出口。
本年度各关税收共计36068595海关两，其中进口税14473462海关两，出口税9492194海关两，复进口税1830540海关两，药土税2338656海关两，船钞1326619海关两，内地子口税2277041海关两，洋药厘金4330083海关两。