1月22日。清廷命两广总督周馥饬提学使认真整顿广东学堂。
清军第一、三、五、六等四镇陆军归第一镇统制官凤山统带。专司其训练事宜。
1月23日。江西铁路总公司与日本大成工商株式会社订立入股合约。大成工商株式会社加入江西全省铁路股本上海规银100万两。
1月24日。清外务部拒绝英使请修新腾铁路。英人多次要求修筑缅甸至云南省城的铁路，未果。本年农历九月，清廷决定自办腾越铁路，驻滇英领事又照滇督，请求中英合修。本日，外务部照复驻京英使拒之。
1月25日。《民报》第11号出版。发表《杂答新民丛报》一文。
《洞庭波》易名《汉帜》在日本东京出版 。《洞庭波》杂志于农历九月发刊一期后改名为《汉帜》，第一期于本日发行。《汉帜》继承《洞庭波》办刊宗旨，鼓吹民族革命。该刊为月刊，由湖南籍留日学生在东京策划创办，由黄一铸任编辑兼发行人，撰述人宁调云、陈家鼎等，共出两期。
1月26日。清廷自开河南开封府南关为商埠。
1月27日 。端方逮捕同盟会会员孙少侯（毓筠）。3月26日，判孙监禁五年。
1月28日。黑龙江将军衙门奏报杜尔伯特蒙旗东界省属夹荒一律勘放完竣。计光绪三十一年三十二年共放毛荒12.2136万垧，扣七成，实地8.5494万垧，每垧按一两四钱收价，计银10.9694万两。又两年共查出熟地1006垧，不收押租，当年起科。
陆军部通咨各省，以后委用军队统带及陆军各学堂总办，应以才学，不拘官阶。
1月29日。革命党人徐敬吾在上海被捕 。次日，上海县知县王念祖将其解往两江督署。
出使日本大臣杨枢派员分往日本各校侦察革命党学生。
革命党人杨卓霖在南京被捕，自认革命不讳。杨卓霖，湖南醴陵人，同盟会员，本年农历四月，奉孙中山命，由日本回国，联络各地会党与军队，曾在南京清军军营中演说革命。浏醴萍起义时，曾在上海计划联络各省会党大举起义。这次起义失败后，卓霖仍奔走联络江苏会党，欲谋刺两江总督端方以起事。部署既定，即携炸弹与同志二人出发。因被告密，途中被捕。本日夜在南京受审，自认奉孙中山之命，运动革命不讳。
1月30日。《民报》发表廖仲恺所译《虚无党小史》。廖仲恺以“渊实”笔名，在《民报》第十一号上发表了烟山专太郎著的《虚无党小史》部分译文，后又在10月25日出版的《民报》第十七号上将全文载完。
本月。《中国新报》在日本东京创刊。由杨度任主编，主张实行君主立宪，要求召开国会。
外务部通知黑龙江将军已派员赴哈与俄商商办设关事宜。黑龙江将军衙门接外务部谏、洽两电，通知该部添派税务司葛诺发赴哈尔滨会同与俄国商办设关事宜，并称俄国已派驻哈总领事刘巴、阿穆尔省税务监督拉特庆、铁路公司代办达聂尔及该公司商务公司总办尺罗莱为出席会议代表。
清廷改刑部为法部 。法部奏文大要为：现今由刑部改名为法部，管辖范围更广。过去大清律例中原有的户律、兵律、工律名目繁多，历来“事机败坏”，均“由于权限不分”，所以现在改制，“自应甚之于始”。过去刑部专任司法，大理院专管审判。而现在官吏的任免、刑事判决和执行、警察调度等事皆由法部专管，应由我部“随时奏明办理”。至于省级刑事案件，关系到人的生命，应当尤其谨慎。案件审理之后经大理院复核，再由法部奏请施行，如果案情不符，仍由大理院驳正。这样，司法、审判各有主管，不至于混乱。
学部奏改京师医学馆为京师专门医学堂。分习中西医学。
2月
2月1日。同盟会会员秋瑾抵浙江金华、兰溪联络会党。访龙华会首领蒋乐山，谋浙江举义。
清廷谕令吉林提督马玉拨10营填防黑龙江省。交黑龙江将军程德全妥善布置，认真防剿“胡匪”。
上海“会审公堂案”以中国赔款了结。驻京英国公使朱尔典照会外交部，提出以赔款、惩办首犯、查办上海道袁树勋三条办法解决1905年上海“会审公堂案”。遂由某官捐私产五万金作赔款，不足之数由清政府承担，了结该案。
铁路交涉总局宋小濂呈请裁撤对青山、富拉尔基分局。以该二处俄兵业已撤退，自无存在必要。其交涉事宜，分别由哈总局、昂昂溪分局兼办。
2月2日。清廷蠲缓山西阳曲等27厅州县、河南永城等44州县被淹地方钱粮。
学部奏准京师法政学堂章程。分两年预科、三年本科、三年别科三种，于是各省法政学堂大盛。
2月3日。度支部奏准于热河创设官银行。热河由于历年禁运，粮食不能出境，银元日少，且外银价格高于内地，致使官府财政短缺，银价苛昂，百物腾贵。廷杰任热河督统后，即以整顿圜法为急务。本日，清廷从度支部奏，创设热河官银行一所，