前田玄以在岐阜城中被自己身边的小姓海保刺杀，凶手拿的是葡萄牙制的转轮铁炮。待前田家的众将一拥而上要擒获他时，海保又对着自己脑门上来了一枪。
待前田家想要把海保家父母兄弟全抓起来时，却发现早已人去屋空。可见三法师的死亡和前田的遇刺，是织田家的敌人早就布下的暗手。这伙敌人提前得知了本能寺之变，刺杀三法师和前田玄以，就是要织田家进一步分崩离析。
天正十年六月初二的本能寺之变，令得到消息的大名们目瞪口呆。第一个得到消息的恰是正在高松城与毛利军作战的丰臣秀吉——当时他刚洗完澡，正在掏耳朵里的水。
在竹中重治死后，成为秀吉手下第一谋臣的黑田孝高踏进大帐，屏退众人附耳秀吉道：“明智光秀前天在本能寺袭杀了信长公——昨天又在妙觉寺围杀了信忠殿下。”
丰臣秀吉惊讶的张大嘴出不了声，掏耳朵的棉棒差点怼到脑仁里。黑田孝高很快就交代了情报来源：是明智光秀派来联络毛利军的使者，因高松城被四面围困而误闯秀吉大营。他看了明智光秀给清水宗治的信件，可以确认是光秀的笔迹。
丰臣秀吉在黑田官兵卫跟前不用装，先呲牙咧嘴抽了一阵凉气。随即问道：“一定是真的吗？”
黑田早已通盘想透，立即建言道：“不管真假，高松城急切难下。何不与毛利家讲和？我们只取清水宗治的人头即撤兵。如果消息是假的，清水宗治的人头也足以给信长公交代；如果是真的——”
黑田如水静静的说出了原时空日本战国史上那句著名的话：“在这世间，只有主公才拥有取得天下大权的能力。”
这样的建议秀吉没有不采纳的道理。于是立即同意了毛利军的交涉请求——吉川元春和小早川隆景这两位毛利军的最高指挥本就害怕信长带兵到高松与之合战，于是同意以清水宗治和他的哥哥剖腹为代价，换取秀吉撤兵。
凭借黑田孝高建议的秘不发丧，丰臣秀吉临走还占了吉川元春一个大便宜。秀吉撤兵的次日，吉川元春也得到了织田信长被杀的消息，气的险些暴走，本欲追赶秀吉，被小早川隆景拉住了——因为殿后的，正是黑田孝高，两人都没有追杀他的勇气。
黑田孝高策划的此次撤兵行动，原时空的日本战国史上有个名堂，叫做“中国大返”。在本时空照样发生，但正如前田玄以提前死了二十年一样，在穿越者的时空是存在bug的。
天正十年六月初九，黑田官兵卫孝高在即将追上秀吉返回姬路城的时候，在城外道路上被潜伏的刺客一枪击中前胸，身受重伤。刺客一击远飏，秀吉军竟然没有抓到行刺的凶手。
同日，三法师遇难和前田玄以被刺的消息也传入姬路城，丰臣秀吉倒吸一口凉气——这一环扣一环的，很有明智光秀的风范！
因为黑田孝高没能参加六月十三日讨伐明智光秀的山崎之战，丰臣秀吉在占领大宝寺这一要点上出现了重大失误——竟然被明智光秀以一万五千兵马击溃。
虽然次日再次聚兵拿下大宝寺，但得到喘息机会的明智光秀得以带领近万残兵逃窜到了龙胜寺。
等丰臣秀吉围困龙胜寺的时候——德川家康、柴田胜家这两大织田家的重要势力也都围了上来，原时空独占为信长公报仇大义的丰臣秀吉，此际在军事和政治上都遭受了重大挫折。
而策划这一切幕后黑手，终于得偿所愿，后织田信长时代经过他的拨弄，丰臣秀吉距离统一日本，一下子变得遥遥无期起来、
......
万历十年的中元节那天，记录织田信长死讯的情报传到了朱翊钧手中。朱翊钧看过情报节略上短短的一句“明智光秀谋反，织田信长死于本能寺。”之后，长出了一口气。
对于日本攻略，在第一征拿下缅甸之后，朱翊钧判断原时空的“猴子”未必会有那个胆子如期进攻朝鲜。蝴蝶翅膀已经煽动，他的目光自然也盯上了日本——在东西方贸易将中国变成“世界银窖”之前，日本的白银将是朱翊钧设立金融体系重要一环。
日本岛孤悬海外，现在内部如同养蛊一般，各方玩命厮杀。而织田信长在拿下武田氏之后，统一天下指日可待——朱翊钧绝对不能允许日本在自己攻略它之前，出现统一的政权。他给军情局的任务是：“只做情报收集，绝对不允许干涉任何一方的势力涨消。”生怕自己胡乱插手，导致“本能寺之变”不能如期发生。
因此，在得知翁大立和吴善言等辈向日本出口军械之后，朱翊钧的怒气难遏。日本的军械生意当然好做，但织田信长掌握着最大财力，向日本出口军械只会加速织田信长对全日本的统一——这与朱翊钧的日本攻略计划背道而驰。
此时接到情报，织田信长如期丧生在本能寺，朱翊钧放下心来。织田信长如期死亡后，才是大明插手的时候。于是，随着本能寺之变的信息传入，当日岐阜城就突燃大火，尚在襁褓中的织田信忠长子秀信和织田家的奉行前田玄以在混乱中被杀。
朱翊钧拿起朱笔签字前，看了看眼