一执混沌钟与巫族十二祖巫迎面对战，战场激荡，不亚于远古龙凤大战，最终，帝俊、东皇太一以及一众妖庭高层战死，十二祖巫战死十一位，巫族近乎全灭，双方落得个同归于尽。巫族十二祖巫之一的厚土大巫，见到双方大战造成生灵涂炭，酿出滔天罪孽，于心不忍又心存愧疚。最终主动兵解，企图以原始盘古精血的力量，护持亡灵之真灵，偿还罪孽。没想到在这个过程中因祸得福，顿悟轮回大道，于未来之海，望的一眼天机。随即以巫族至宝六道轮盘为支撑，构建轮回，建立了今天的地府体系。六道轮盘化为六道轮回盘引得天地至宝地书出世，化为生死簿，成为地府另一个至宝，记载万灵之寿命本源。
巫妖大战以近乎同归于尽的方式结束，天地生灵锐减，不足原来三成，一时间洪荒再现远古萧瑟。
女娲创立的人族，在巫妖大战中经历重重磨难，得以存活，然而最初的一批人族全部战死。后来人族大能燧人氏临危受命，力挽狂澜，带领人族万里迁徙，直至南部洲，最终十不存一。
洪荒再一次陷入了混乱之中。
这时道祖合道结束，显圣洪荒；三清出关，正式设立玄门；女娲避世，远居涡皇宫；西方二圣，创立西方教，广招门徒；祖巫厚土，身化轮回，虽无鸿蒙紫气，却也胜似圣人，坐镇六道轮回盘。
道祖以天道之名重建天庭，立身边童子童女为天帝王母，执掌洪荒正统，天庭正式建立。
这便是洪荒的远古与上古，龙凤大战被称为龙凤初劫，巫妖大战被称为巫妖量劫，洪荒经此二劫，后天生灵彻底崛起，成为天地主流。后来，道祖定人族为天道种族，凝人族气运，享天道庇佑，人族在经历巫妖磨难后，走向大兴，人族外形也成为其他生灵化形首选。
自此，现在洪荒格局基本形成。