经此一役，明朝受到巨大震动，元气大伤。
皇太极还未退兵，阉党余孽，就开始筹谋掌控阁部。
明廷没有认真地总结经验教训，而是借机倾轧，进行党争。
崇祯帝没有从全局分析北京己巳之役的历史经验和教训，而是以抓袁崇焕出气、泄愤。
阉党余孽借机翻逆案，打击东林党。
东林党内阁大学士韩爌、钱龙锡、成基命、李标等去职，而代之以周延儒、温体仁等佞臣入主内阁。
袁崇焕是崇祯时抵抗后金的名将，督师蓟辽，后金多次入侵，均被崇焕挫退。
崇祯二年(1629)，后金军绕道古北口入长城，进围北京。
后金兵进入京城附近，京师戒严。
袁崇焕闻讯后率部星夜驰援京师，获广渠门、左安门大捷，力解京师之危。
当初，袁崇焕上朝，曾跟钱龙锡谈论边防事务。
钱龙锡是东林党首领，王永光等人阴谋利用袁崇焕制造大案，可以将东林党一网打尽。
王永光带头说后金兵的进攻，是由于袁崇焕杀害毛文龙导致的。
高捷于是带头攻击钱龙锡，驱逐他。
不久也将袁崇焕逮捕下狱。
崇祯三年正月，中书舍人原抱奇，弹劾韩爌主政误国，招敌欺君，毁坏省城，国家濒临危亡，不能想出一个计策、选拔一个人才，坐视国家的成败，把国家命运寄托在偶然出现的机会上，应该和钱龙锡一起排斥。
他所说的主和者是因为韩爌是袁崇焕的中进士时的老师。
皇帝重视韩爌，降了原抱奇的官级。
不久，左庶子丁进因为提升延误了日期怨恨韩爌，也弹劾他，而工部主事李逢申跟着上疏弹劾韩爌。
韩爌无奈，三次上疏称病。
下诏赐给他白金、彩色丝织品，乘驿车派遣行人护送他回家，全部都如常法一样。
庄烈帝时，钱龙锡历官礼部尚书、太子太保，文渊阁大学士。
李标为首辅，龙锡与刘鸿训协心辅理，朝政稍清。
审理魏忠贤逆案多半由他主持，奸党分子对他恨之入骨。
钱龙锡极力举荐袁崇焕为东北关宁（今山海关，宁远）军统帅，巩固边防。
等到袁崇焕杀毛文龙，他被弹劾为与袁崇焕同谋越权擅杀大臣等多罪。
遂托病辞官归乡。
当时的魏忠贤余党聚谋污蔑袁崇焕为逆首，钱龙锡等为逆党。
在袁崇焕被捕入狱之后，钱龙锡因袁崇焕案受到牵连，同样被捕入狱。
崇祯在平台召见中，逮捕了袁崇焕，当时在场的成基命观察到大寿在一旁双腿颤抖的异态，认为有发生叛乱的可能，便主张慎重处理，被毅宗拒绝。
祖大寿回营后果然毁山海关东出反叛，成基命提出由袁崇焕写信召回。
在孙承宗的协力下稳住了祖部的军心。
成基命在危局多次提出建议被采纳，得到了崇祯的信任。
但在召对中，基命提出施政从缓，与崇祯所想相反，使他难以为崇祯所任用。
在袁崇焕案的事件，成基命持保袁崇祯活命的态度，并想阻止对钱龙锡的牵连。
但其身为能力有限，未能影响大局。
到了此时，周延儒党羽已丰。
成基命接连受到攻击，指斥其在袁案中委卸避事，有欲将其牵入的迹象。
成基命感到大势已去，为保全自身，于崇祯三年正月致仕。
内阁成员大部已去，独标在，遂五疏乞休，崇祯准，于崇祯三年正月致仕。
内阁大臣们相继辞去之后，六部九卿也相应变更。
皇太极还没退走，大明的朝堂上却已经乱成了一锅粥。
崇祯皇帝，面对如此现状，开始思己过。
初登大位，一心求治，颇想要有一番作为；而后韬光养晦，灭掉了只手遮天的魏忠贤阉党；一时间万象更新、众正盈朝，一片中兴之景。可唯独这关外辽东显的格格不入，好在还有袁督师。
一见面袁督师就领着皇帝做起了五年复辽的美梦，有了袁督师及时递来的这个大枕头。
崇祯意气风发，面对袁督师，要权给权、要钱给钱、要人给人……只待五年后，天下太平，海晏河清。
功比东汉光武、本朝孝宗的美名是跑不了了。
只可惜这美好只是持续两年多，看着城外肆虐的皇太极大军，崇祯只想即刻将袁崇焕斩杀了。
遭此大变，崇祯仔细的审视了自己曾经的所作所为，他猛然发现，自己竟然成了被困皇宫这座金丝笼中的鸟。
面对前线、面对天下，朝臣说什么，自己就只能顺着他们所说的做下去，要不然他就没有好日子过。
崇祯冷漠的看着朝中各个大臣为了内阁，为了六部九卿的官职，争的面红耳赤的时候，他悄悄派出了自己的耳目潜入了各地各镇各府。