子铭和众人在船上呆了一会，粉鱼打了个哈欠说：“哈，到底什么时候才到真新镇啊。”子铭看了看地图说：“快了，应该还要行驶半个小时，不过也快到了。”香橙拿出一杯冰淇淋开始吃了起来，子铭粉鱼说：“香橙，别吃这么多冰淇淋，你忘了你上次在厕所拉了多久吗？”香橙一边吃一边说：“没事没事，反正闲着也是闲着，我吃完后，我们把那些落下的课程给补上。”粉鱼一听立马跑开了：“我才不要呢！我才不要复习！”而香橙则是抱着冰淇淋追了上去。子铭摇摇头说：“可怜的粉鱼。”羽翼灵纱在船上看着沿途的海景，又看看手上的翼之石，心想：希望可以早点回家，我现在，已经有能力保护自己的家人了。这时，她感觉有谁在注视着自己，一转头发现，只有一道黑影闪过，她自言自语道说：“是我看错了吗？”这时，船舱里，沙奈朵问跑回来的艾路雷朵：“找到安安了吗？”艾路雷朵摇摇头说：“没有，但是那个训练家多了一个很奇怪的口袋妖怪，跟姐姐你差不多，但是看样子是飞行系的。”这时，身为母亲的沙奈朵哭着说：“那个孩子真的不在船上吗？”沙奈朵扶起母亲，说：“没事的妈妈，我们会找到她的，一定会。”
过了一会，子铭发现周围的景色变得熟悉起来：肯泰罗在和主人耕地，小火马在帮忙拉车，子铭惊喜的站了起来：“到了！我们到真新镇了！”香橙一听，兴奋的跳了起来：“终于到了！我终于可以见到大木博士了！”过了一会，船停了，大家拿上行李下船，羽翼灵纱在下船的时候发现：两个黑影从船上跳进了树林里，说：“怪了，那两个黑影怎么这么眼熟？”抱着这样的疑问，羽翼灵纱跑下了船，向着出现黑影的树林那里飞了过去。
“我回来了！”子铭推开家门，但是里面一个人有没有，“奇怪了，家里怎么这么安静？”子铭走进家门，这时一个人在背后拿水枪射了子铭的后脑勺，子铭一个激灵掏出精灵球说：“别动！”但是老妈捂着嘴笑着拿着水枪走了出来：“小子，这么久不回家还不准老妈开个玩笑啊？”而对于老妈的恶作剧，子铭只要一笑而过了。
这时，香橙和粉鱼来到了大木研究所，粉鱼推开门，说：“打扰了。”但是回应她们的，是很大的吵杂声，香橙警觉的说：“不对，有情况！”然后立马跑向大厅，但是眼前的一幕让她愣住了：子铭收服的伊布让大木博士他们忙的不可开交，月精灵刚刚安抚好一只伊布，另一只伊布又吵了起来。好一会，才把全部六只伊布给安抚好了，大木博士说：“真是够闹腾的。”但是没等大木博士反应过来，香橙就迫不及待的喊了一声：“大木博士好！”香橙这一声直接把大木博士他们刚刚安抚好的伊布给吓到了了，于是，房间里面的伊布们又开始闹腾了起来。大木博士和小建瘫倒在地上：“不是吧，又要来啊。”香橙不好意思的说：“抱歉，我真的，有点兴奋过头了。”
这会，子铭来到了口袋妖怪中心：“大木博士，好久不见了。”这时，月精灵和伊布们，一看见子铭就冲了上去和子铭亲热起来。子铭抱着月精灵说：“好了好了，我知道你想我，还有其他的伊布们。”月精灵兴奋的跳了起来。
过了一会，伊布们在月精灵的带头下整整齐齐的坐在地上，大木博士说：“唉，终于安静了。”子铭说：“抱歉啊，我其实，也不想收服这么多伊布的。”小建说：“算了算了，对了子铭，我记得之前你好像，从我这里拿走了七只口袋妖怪吧？你身上的口袋妖怪有：皮卡丘，穿着熊，沙漠蜻蜓，梦妖魔，达克莱伊，沙奈朵，还有克雷色利亚，你是怎么做到一次带七只口袋妖怪出门的？”子铭尴尬的笑了：“其实，那只克雷色利亚不是我的，是一个人要我代为保管的。”子铭心想：要是我说那是从未来来的小鬼的口袋妖怪你们会信吗？这时，电击魔兽从发动机房走了出来说：“克里克里（发电机电量充满了）”大木博士说：“哦，那谢谢你了电击魔兽。”子铭说：“好久不见了，电击魔兽。”电击魔兽说：“克里克里。（好久不见，我先走了，有事再找我。）”说完，走到后院去打盹了。
“对了博士，你知道奇迹进化吗？”子铭兴奋的问，大木博士说：“我是听说过奇迹进化的传闻，但是我觉得那应该是某些人的恶作剧吧。”子铭兴奋的说：“那不是恶作剧！我这，就有一只奇迹进化的口袋妖怪！”大木博士一听，立马也开始兴奋了起来，说：“哦！是吗？它在哪？”子铭说：“应该在后院，我叫她过来。”说着，跑进后院，大喊了一声：“羽翼灵纱！！”
但是大伙却当做看傻子一样看向子铭，弄得子铭好不尴尬，大木博士说：“别喊了，你带来的只要五只口袋妖怪，已经在训练了。”子铭说：“不太可能吧，我记得她应该跟住我的啊。”话刚说完，羽翼灵纱从天而降把子铭压在了身下，只见她摸了摸眼角的泪水，说：“还是要好好练习飞行。”突然，大木博士和小建大吃一惊：“哇！这是什么口袋妖怪啊！”这一叫把羽翼灵纱吓了一跳，羽翼灵纱说：“什么情况？”子铭站起来说：“博士，这位是羽翼灵纱，是沙奈朵奇迹进化后的样子，羽翼灵纱，这位就是