所以然，重病时下了一贴猛药，不知道这百年积弊，要改谈何容易？反而是造成了军心更加不稳。
其实这时候要选也要选威望最高的吴世恭。再怎么样，各路官军的主帅，还是最信服最会打仗的吴世恭的。而且吴世恭兵多将广，盟军也多，起码可以在河南、湖广控制住全部局面。至于吴世恭是否有异心，作为总理的杨嗣昌其实也可以就近监视、控制的，总比放任不管的好。
可是杨嗣昌对吴世恭也是不闻不见，而吴世恭也未参加襄阳军议，未给杨嗣昌任何面子，这样一来，与吴世恭有着仇怨的杨嗣昌和左良玉根本调动不了汝宁军，所以在之后的战斗中，根本借不到汝宁军的丝毫助力。
而崇祯皇帝对于杨嗣昌的各种请求差不多是言听计从，立即批准任命左良玉为平贼将军，把内府的大印派专员驰送前线。左良玉也确实颇为感奋，秣马厉兵，准备对张献忠大战一场，以雪前仇。杨嗣昌则并不急于发兵，而是积极整顿部队，调配力量，囤粮输饷，巩固后方，准备蓄力而发，一举取胜。
而此时崇祯皇帝对杨嗣昌的支持丝毫未减少。就是朝臣们在杨嗣昌督师亲赴前线之后，出于一种对大臣身临战阵的尊重，也停止了对他的各种攻击。只有兵部因为要同这位在外的枢辅不断地打交道，不免发生一些龃龉。
而杨嗣昌不断有兵饷方面的要求，兵部很难全部满足，而且有些事情是有制度成例的，兵部也不愿随意改动，破坏了规矩。崇祯十二年底，杨嗣昌疏劾兵部不任职守，妨害围剿大计。兵部尚书傅宗龙虽然是杨嗣昌推荐上来的，却对他的以势压人很不服气，就回了一本，说杨嗣昌“徒耗国家军资，不能立功报效，并以势欺凌朝廷大臣”。
可是崇祯皇帝对傅宗龙在关键时刻不能同督师同舟共济非常恼火，正巧兵部又在辽东用人的问题上有一个失误，就以玩忽职守、戏视封疆的罪名把他逮进监狱。刑部拟罪遣戍，崇祯皇帝不肯，大有置之死地之势。又一位重臣因为得罪了杨嗣昌入狱去了。
在罢免傅宗龙后，崇祯皇帝任用杨嗣昌一直极力推荐的陈新甲为兵部尚书。陈新甲是举人出身，在明代历史上以举人而任尚书的只有寥寥数人，因而正牌进士们很不服气。但陈新甲确实是个干才，思路又同杨嗣昌相近，因而在本兵任上对杨嗣昌给予了很大的支持。
有皇帝全心全意的信任，有兵部尽心竭力的配合，又有阁部督师的巨大权威，杨嗣昌就准备摩拳擦掌大干一场了。于是在这年年末，他在楚、豫、川、陕各省四处张榜，上面刻印着张献忠的头像，并下书赏格：“能擒张献忠者赏万金，爵通侯。”
可是榜文张出后不久，就有人在杨嗣昌行辕的大门上贴了“有斩阁部来降者赏银三钱”的传单，弄得杨嗣昌疑神疑鬼，以为身边尽是农民军的奸细。
但不管怎么说，杨嗣昌已经做好了充分的准备，于崇祯十三年闰正月，调集的各路明军正式对张献忠部发起围剿。
而在这时候，罗汝才因为受不了张献忠盛气凌人，已经同张献忠分手了。罗汝才此人江湖义气很重，纵然屡次被张献忠欺压、出卖，但最多也就是散伙，决不闹翻脸，也不出一句恶言。他一贯拿的一个原则是：“朋友们好合好散”、“留下见面之情”。于是罗汝才在与张献忠同好商好量，赔了不少笑脸以后，在竹山境内分开。
就在此种情况下，杨嗣昌围剿农民军的战斗正式打响了。