恰在此时，黄巢正在长安调兵遣将，准备扩张地盘，占领荆、襄之地，控制南北水陆通道。黄巢命令手下第一勇将朱温进攻邓州，进而攻打荆、襄等地，又派出第二支部队，由尚让、林言率领，攻打凤翔。
一日，有卫士来报，京城某书院墙上，写有一首诗，其中两句为“昔时沐猴而冠人，今日又入长安城”。黄巢略通文墨，看到此句诗，勃然大怒，召集翰林大学士裴渥议事。裴渥听罢，沉吟道：“此诗实乃讽刺皇上。当年西楚霸王项羽进入咸阳，韩生劝道：关中地势险要，有山河屏障，土地肥沃，可以都霸。项羽见宫廷已经烧毁，又想东归，就说道，富贵不归故乡，如衣锦夜行，谁人知之？韩生私下说道，人云楚人沐猴而冠，果然。项羽闻言就将韩生烹死……”黄巢遂下令，命令全城搜查题诗之人，裴渥带领众军士遍查长安城儒生而未得。
此时狱中所关儒生已过千人，题诗之人杳无音讯，黄巢怒从心头起，下令抓捕全城读书识字之人。一时，长安三千多名儒生，尽皆被抓，唐朝官员子弟识字者也均在其内。黄巢下旨，将三千多名读书人尽数处死。当日，三千余众被押赴刑场，百姓人人封门闭户，无人胆敢上街观看。三千余名儒生与公卿子弟尽被捆绑，长安街道络绎不绝，绵延数里，军士的呵斥声，鞭打声，众囚徒的哭骂声、哀求声，响彻云天。杀戮从清晨持续到午时，一批被杀之后，第二批即刻被押赴刑场。长安城中惨叫之声此起彼伏，满街头颅横飞，尸首横卧，血光遮天蔽日，浓烈的血腥之气久久笼罩在长安上空……
黄巢又命军士烧毁官员府库、书院，将儒生尸首一起烧掉。后翰林学士、诗人皮日休不忍卒睹，写诗曰：“内库烧为锦绣灰，天街踏尽公卿骨”。一时间，长安城中，家家戴孝，户户治丧，百姓人人敢怒而不敢言，栗栗危惧，惶惶不安，人人心想，大齐皇帝残暴凶狠比大唐皇帝胜之百倍。百姓心中倒开始盼望大唐皇帝能够重新回来。现在的皇帝比当大唐皇帝更加残忍、暴虐、狡诈、虚伪……
两个月后，长安皇宫收到前方传来的捷报，东南面行营都虞侯朱温已经攻陷邓州，控制住了荆、襄之地。远在成都的唐僖宗也诏令镇东、太原、代州等节度使发兵京师讨伐大齐，大唐宰相、凤翔节度使郑畋联合与泾原、秦州、鄜延、夏州等节度使同盟起兵，传檄天下。
当时，尚让与林言久攻凤翔不下，尚让驻军城外，听闻郑畋率军到达凤翔，大笑对林言道：“本相听闻郑畋乃一介书生，唐朝皇帝命书生领兵，气数已尽。如今郑畋原道而来，劳师以远，我等今夜奇袭其营帐，必定一举拿下，斩其首级。”林言大笑称是，二人秘议已定。
当夜，尚让与林言带领三军，人衔枚，马裹蹄，乘着夜色偷营。众军来到龙尾坡郑畋营外，只见营中一片漆黑，寂静非常，营外亦不见巡逻的士兵。四下不见一人，营中虚插旗枪，众人觉惊奇，尚让惊觉，情知中计，此地定有埋伏，惊慌下令：众军调头，速速退军。正在此时，四面喊声震天，宰相郑畋的部队与朔方节度使唐宏夫军队于四面杀来。齐军大乱，争相奔逃，尚让数次下令，众皆不听，齐军尽被冲散，人马自相践踏而死者无数。
大齐五万部队，丢盔弃甲，逃出数里之后，清点人马，已损兵数千，军器辎重丢失无数。军中哀怨之声不断，林言拍马赶上尚让道：“郑畋领大军设伏，凤翔城必定空虚，只有少数军士守城，何不乘此机会攻下凤翔，驻守等待援军？”尚让寻思有理，调转马头，领兵直奔凤翔。行至城外，尚让远远望见凤翔城楼果真无人守卫，城门虚掩，偃旗息鼓。尚让正待下令攻进凤翔城，突然后方杀声震天，火把通明，距离大军约一里之外出现一支军，为首一将正是郑畋手下将领宋文通。
尚让见计不成，无心再战，急令众军撤退。宋文通率军冲杀，一路追到咸阳，大齐军兵败如山倒，一路之上，被唐军杀死或者自相践踏而死者两万余众。尚让与林言带残兵意图退回咸阳，忽闻原降将夏绥节度使诸葛爽背叛大齐，率领部队已投降郑畋。此刻正与郑畋合兵一处追杀而来，尚让大怒，破口大骂，却不敢进驻咸阳，一路向长安方向撤退。
两日后，尚让部队已离宋文通追军百里之外，尚让寻思追军日内不至，于是驻扎休整。忽探马来报，前朔方节度使唐宏夫与前泾原节度使程宗楚率军前来，已收复咸阳，渡过渭水。尚让大惊之下，与林言商议：“倘我军再退，则长安危矣，不如以逸待劳，趁唐军立足未稳，将之击溃。”林言道：“首辅大人率军两万攻击唐军左翼，卑职率军攻击其右翼，可一战成功。”尚让命军三更造饭，五更出发，与唐军战于渭水之畔。驻守渭桥的唐军将领王处存收到讯息，轻骑赶来助阵，两军合并，尚让与林言部队大败。唐宏夫、王处存乘胜追击，直逼长安。
深夜，长安宫中，黄巢正坐在太极殿，一边饮酒，一边欣赏伶官命宫娥新排的舞曲。忽闻殿外一片嘈杂。禁军首领慌乱不已地跑进殿中，气喘吁吁地跪地启奏：“皇……皇上，唐……唐军已至长安城外，已开始攻城，驻城守军无法阻挡，不日将攻破城门”。黄