很快，龙魂特战队又用类似的手法“拿下”了另外一艘鬼子的油轮。而后，龙魂所有的幽灵舰船又进入了隐形幽灵模式。就好像从未在海面上出现过一样。
在日本鬼子还没有搞清楚到底出现了什么状况之时，他所有偷袭珍珠港的“支援部队”就都这么失联了。
这一来，就立马令日本海军指挥部疑神疑鬼了，难道说是美军是以珍珠港为诱饵，在太平洋下布下了一个很大的口袋？
在日本海军先头部队偷袭珍珠港的同时，伏兵于背后对着日本海军下手吗？
日本海军的总指挥山本五十六越想越害怕。
本来在日军偷袭珍珠港的预案当中，要对珍珠港进行三个波次的空袭，但在后勤补给部队失联之后，山本五十六下令第三波次的舰载机轰炸攻击取消。
让正在前沿指挥航母舰载机向珍珠港发起攻击的南云忠一海军中将尽快撤退。
南云忠一中将对于这个突兀而来的命令很不理解也很不满。
他在“赤城”号航空母舰上嘟囔着：“山本这个家伙脑袋是不是叫艺妓给夹了？”
“在这么关键的时刻，他居然下令让我们撤！”
“现在是他说撤就撤的时候吗！？”
南云忠一的抱怨也并没有什么毛病，因为此时第二波次的舰载机正在珍珠港内执行轰炸任务，还没有飞回来，要是现在航母编队就往回撤的话，无异于将那些舰载机全部给抛弃不顾了。
如果真那么干的话可以说是非常卑鄙无耻而又不符合实际的愚蠢行为。但山本五十六恰恰就在做出这样的指挥，这让南云忠一很不理解。
思考再三之后，南云忠一决定执行第二个命令即停止第三波次的轰炸行动，但对于航母撤退的命令，他要暂缓执行，因为他要等到自己派出去的第二波舰载机轰炸完毕之后，再命令航母撤离。
他最心疼的还真就不是那些舰载机，而是那些亲自调教出来的飞行员，那些日军飞行员是为了执行偷袭珍珠港任务而训练出来的精锐当中的精锐，耗费了南云忠一大量的心血和感情。
在南云中将的心目当中，此生能够干出偷袭珍珠港这么大的一次攻击行动，就不辱没他作为日本帝国海军军人的身份了。
而这些舰载机飞行员正是实行他野心攻击的工具，他是不舍得过早的地舍弃他们的，南云忠一要等一等，再等一等。
此刻在珍珠港内，日军第二波次的轰炸正在逐渐进入，两艘美军驱逐舰、两艘美军战列舰，都相继在日机的轰炸下被击沉，而这时美军的状态也从最初的手忙脚乱转换为火力应对，防空火力也开始对于日机进行还击，甚至还有舰船试图从珍珠港内逃走，但它们的努力都失败了，都被日机炸沉在海面上。
从表面上看，日军的偷袭无疑取得了特大的胜利，日机以极为微小的代价，就炸沉了许多美军的军舰，但在实质上，日军的作战却并没有达到他预案当中的战术目标，他原本的目标是想炸沉美军的航母，却没有料到在珍珠港内连美军的一艘航母都没有。
而就在这个时候，战事又发生了微妙的变化，原本看起来被彻底打懵，毫无还手能力的美军居然又有了反击动作，从珍珠港周边一些边远机场起飞的美军战机赶来参与空战，美军开始一些没有来得及做出反应的防空火力点也哒哒哒地反击，日军第二波次的轰炸机也有战机被击落下来，拖着黑烟滚向了波涛汹涌的海面。
在空中和海面进行激战的同时，在水下一场暗战也在激烈展开，原来在航母抵达攻击位置之前，日军就派出了先遣部队偷偷地驶进了珍珠港，所谓先遣部队就是潜艇部队，由五条微型潜艇组成。
这些潜艇接到的任务就是当偷袭珍珠港的海空大战一旦打响，悄悄潜入珍珠港的潜艇就发射鱼雷，这样舰载机在空中轰炸，潜艇再在水下发射鱼雷，上下齐攻，双管齐下，就算是美军的舰船铁皮再硬也会被击沉。
但万万没想到的是日军这支潜艇部队命运多舛，一进入珍珠港外围海域，还没有执行任务的时候，其中一艘微型潜艇就被美军驱逐舰给击沉了，没有发挥出任何作用就当了炮灰。
这也充分证明日本其实从来就不是一个真正的海战强国，这在使用潜艇战术的蹩脚上就可见一斑。
另外四艘日军的微型潜艇悄悄地潜入了珍珠港内之后，却没有想到更大的麻烦还在后面，在珍珠港内也有美军的潜艇等待着与他们较量。
嗖！嗖！嗖！两军潜艇展开鱼雷对攻，几个回合之后，又有三艘日本鬼子的微型潜艇被打掉。
就这样日本鬼子的先遣部队微型潜艇编队不但寸功未立，事实上还被美军打得屁滚尿流。
而美军的潜艇在二战当中也并不是顶尖水准，充其量也不过就是二流角色，被二流水平的潜艇给打得这么惨，也足见日本鬼子使用潜艇的技术有多么烂了。
但技术烂归烂，这艘最后幸存的日本鬼子微型潜艇还在亡命地向珍珠港外逃窜，因为这艘潜艇的舰长还是有着这样的幻想就算