李经述深知军校最重要的就是思想工作，要让军官忠诚听指挥，必须有一个统一的核心思想，他结合当时内忧外患的大局势，将陆军军官学校的核心思想定位“保家卫国”，让徐世昌写了一副对联，题在校门处：“升官发财请往他处，贪生怕死莫入此门”。
后来，陆军军官学堂全体学生编为五个大队，每大队四百人，共编为步、马、炮、工、辎五科，在课程设置上，军事课设：基本战术、应用战术、图上战术、战略学、孙子兵法、管子兵法、沟垒学、弹道学等，多是请德国洋教员上课；文化课设国文、算术、几何、三角、地理、格致等，李经述还把淮军大将刘铭传、北洋水师学堂的教习严复也请来给陆军学堂的学员们上课。有时为了跟朝廷大员搞好关系，也请他们来讲课，比如刘坤一。
李经述还想给北洋陆军军官学堂定一首“校歌”，徐世昌马上想起袁世凯说的在朝鲜练兵的那首打油诗，还结合军官学校的授课特点，略加改动，写了这首校歌：
朝廷欲将太平大局保，将军统领遵旨练新操。
方今中国文武学堂造，不比市井蠢汉逞粗豪。
第一立志要把君恩报，第二功课要靠官长教。
第三行军莫把民骚扰，我等饷银皆是民脂膏。
第四品行名誉要爱好，第五同军切莫相争吵。
各营之中枪队最为要，望牌瞄准莫低亦莫高。
炮队放时须要看炮表，安放药引须按度数标。
轻炮分工不愁路窄小，重炮车载马拉不觉劳。
马队自己须将马养好，检点蹄铁切勿伤分毫。
临敌侦探先占敌险要，我军酣战从旁速包抄。
工程一队技艺须灵巧，陆地筑垒遇水便搭桥。
辎重队里事事算计到，衣粮军火缺乏不需焦。
李经述把“第一立志要把君恩报”改为“第一立志要把亲恩报”，定下了校歌。徐世昌结合普鲁士军歌《德皇威廉练兵曲》的曲调谱曲，把它编成了北洋陆军军官学堂的“校歌”，让每个入校的军官第一件事，就是把这首歌记牢唱熟。
在武器装备上，李经述这次也下了血本，请驻德大使李凤苞在德国购置过山炮、半陆路炮，步兵骑兵则买来复枪、毛瑟枪，还有天龙步枪和飞龙机枪。李经述还给军官们买了时表、双筒望远镜、雨衣雨帽、洋鼓洋号。全部采用新式练兵方法。
李经述对第一期学员倾注了巨大的心血，对段祺瑞、冯国璋、王士珍都格外照顾，比如段祺瑞的弟弟妹妹在合肥老家，李经述派人把他们接到天津，还赠送了一套住宅给他们。冯国璋家里缺钱，李经述一出手就是一百两纹银，雪中送炭。王士珍和寡母住在一起，他的母亲年事已高，有眼疾，李经述派人去给她找最好的郎中治病。段祺瑞、王士珍、冯国璋对李经述誓言效忠。
对其他学员，李经述也用心良苦，每一次发学饷，他都亲自去送到每一个学员的手里，对他们嘘寒问暖，看看他们家里有什么困难，能帮助解决的尽量解决，日子久了，李经述几乎都能叫得上每一个人学员的名字，这些学员一看这高官二代，跟以前压榨他们油水的长官有天壤之别，对李经述也死心塌地。
北洋军校第一期学员大都出身卑微，训练刻苦，不久，就小有所成，出操用炮，也有模有样了。李经述觉得时机成熟了，就请李鸿章来陆军军官学堂视察。
李鸿章到了校门处，看到“升官发财请往他处，贪生怕死莫入此门”的对联，夸赞道：“好，有志气！”再看学员们的会操，想起了自己当年练淮军的情景，不禁夸赞李经述“将来必青出于蓝而胜于蓝”。
李经述知道李鸿章从安徽合肥农村走出来，现在成了大清帝国的头号汉臣，他本人就是一个传奇，是淮军学员们仰慕、人人欲效仿的偶像，所以趁机请李鸿章作重要讲话，李鸿章犹豫了一会，觉得自己确实有很多话想要讲，便答应了。
当时，练兵场的天空飘起了小雨，两千多个学员站得笔挺，在雨中听完了李鸿章慷慨激昂的演讲，这一场“师夷长技以制夷”的演讲振聋发聩：“老夫窃惟欧洲诸国，百十年来，由印度而南洋，由南洋而中国，闯入边界腹地，凡前史所未载，亘古所末通，无不款关而求互市。我皇上如天之度，概与立约通商，以牢笼之，合地球东西南朔九万里之遥，胥聚于中国，此三千余年一大变局也。我朝处数千年未有之大变局，窃以为天下穷则变，变则通。中国士夫沉浸于章句小楷之积习，以致所用非所学，所学非所用，中国文武制度，事事远出西人之上，独火器万不能及。故以为中国欲自强，则莫如学习外国利器；欲学习外国利器，则莫如觅制器之器，师其法而不必尽用其人，欲觅制器之器与制器之人，则或专设一科取士，中国但有开花大炮轮船两样，西人即可敛手！火炮之利，有赖诸君了！”
李经述一听，心想这还是“西学为用”的老调子呀，看来李鸿章虽然贵为晚清中国第一汉臣，思想也是有历史局限性的。