他的初阵。次年，成政收不破河内守盛国的次子成光为养子，即佐佐右马头成光。
天正3年（1575）5月，不甘心上洛失败的武田胜赖终于忍耐不住，不管众人的劝告，点起甲信大军，主动挑起战端，直奔骏河。武田军与织田.德川联军在长篠设乐原对阵，织田.德川联军运用新的战法——防马栅与铁炮三段式填装法，以此战胜了武田胜赖的骑兵团。“三段式填装法”即是将铁炮兵分为三列，在同一时刻，第一列的士兵she击，第二列的士兵处于点火状态，第三列则在填装弹药。佐佐成政与前田利家等人在长篠合战中作为铁炮奉行，表现活跃。
长篠合战后，织田家的进攻矛头开始指向北陆。天正3年8月，成政随信长出阵讨伐越前一向一揆，此战是成政作为信长直属的最后一战。战后佐佐成政、前田利家与不破光治（府中三人众）被信长分封在越前，成为柴田胜家的寄骑，同时负责对柴田胜家的监督工作。20ri，成政等人又被授予府中二郡，成政此时也开始修筑自己的本城小丸城。
越中入国
天正6年（1578）3月，有着“军神”之称的上杉谦信突然病死，随后谦信的两个养子景胜和景虎开始争夺家督之位，即御馆之乱。织田信长并没有放过这个天赐良机，信长于同年4月在二条城对神保长住下达了入侵越中的命令。长住原本是越中神保长职的嫡子，因为自己亲近一向宗及武田家，而与亲上杉势的父亲发生矛盾。永禄12年（1569），长职在上杉谦信的援助下彻底镇压了家中的反上杉势力，长住也被追放出越中。流浪的长住前往投靠信长，信长认为长住有很大的利用价值，于是收留了他，并且予以厚待。
4月下旬，神保长住与成政之弟佐佐政纲（长穐）率军经由飞騨国进入越中，长住很快便拉拢了一批国人众，在越中立足。此时离神保长住被追放出越中的时间已过8年之久。
天正7年（1579），成政被任命为陆奥守，信长似乎在这时就已打算将来让成政负责对陆奥方面的攻略。天正8年（1580），信长将妹妹嫁与神保氏，同时派遣佐佐成政进入越中援助神保家，与上杉家对抗。佐佐成政虽然被授予一国知行权，但这也只是形式上的，实际上成政的权利只限于砺波、新川两郡，并且当时的新川郡还在上杉家的支配之下。尽管如此，成政依旧在越中入国后大展身手，成为独镇一方的大将。
当时的越中水患不断，刚刚赴任的成政利用冬季的停战期(11月～翌年3月左右)致力于越中的治水事业——越中有神通川与常愿寺川两大河川，山上的雪融水多由这两条河川注入ri本海。越中水灾频繁，特别是常愿寺川洪水的泛滥当地人带来很多麻烦，常愿寺川一次泛滥的水量可达45000吨，为平时正常水量的750倍。水流在碰上松木.冈田之间的悬崖后，会向右改道，然后在岩峅寺的悬崖处向左改道，在河川西岸的马瀬口形成大洪水。成政在马瀬口修筑了一道“佐佐堤”，堤长150米，三面铺石，底宽45米，这道堤把洪水推回河川zhong yang，降低了洪水对河西岸的危害。佐佐堤建于天正8年（1580），是越中的第一道“霞堤”，所谓的“霞堤”，并不是与河川平行，而是有一定的斜度，用以推开洪水。“佐佐堤”的修建安定了领内的生产，也使成政获得了领内农民的景仰。
天正9年（1581）2月28ri，信长在京都举行“马揃”。3月9ri，趁佐佐成政和神保长住上洛面见信长、参加“马揃”之际，上杉方河田丰前守、上杉景胜围攻成政方小出城。成政在向信长献上鞍，铠，黑铠等礼物后，便迅速回到越中指挥作战。3月24ri，成政军越过神通川、六道寺川进入越中中部。上杉势闻讯后开始撤退，成政军势渡过常愿寺川、小出川继续追击，不过最终没能赶上。战后信长对此战大为赞赏，并任命成政为越中守护。在这一年中，佐佐成政对越中的各个反对势力如安养寺御坊、瑞泉寺等进行攻伐，对土肥政繁等亲织田的国人势力进行扶持，同时修缮防御工事，以此在越中稳住阵脚。
天正10年（1582）2月10ri，柴田胜家率佐佐成政、前田利家等人进攻上杉方鱼津、松仓两城。3月11ri，神保长住父亲——神保长职的旧臣小岛职镇、唐人亲广等越中国人众趁成政军势在外，占领富山城并幽禁长住。柴田胜家得知后方有变，立即率众将返回进攻富山城。据说成政为了保全长住的xing命，希望能够以议和的方式解决此次事件，因而与主张强攻的柴田胜家激烈争吵了一番。3月13ri，甲信方面织田军攻灭武田家的胜报传来，围城的织田军士气大振，借此机会一举夺回富山城，其后挥军东进继续进攻鱼津.松仓。富山城占据事件之后，神保长住失去了信长的信任，被追放出越中，成政得到了越中四郡的知行权。
神保氏的失势，让佐佐成政成为了名副其实的越中国主，成政的本城也从守山城移至富山城。
6月2ri，本能寺之变，织田信长及子信忠身死。毫不知情的织田军依旧对鱼津城发动攻击