4月15日。日俄两国驻军撤出东三省 。日本依照1905年订立的普里茅斯条约，采取撤兵行动。至4月11日，除铁岭、奉天两处仍驻日本铁道守备队外，日军均撤离东三省，并将辽宁省的治理权交还清政府，交接事宜由徐世昌办理。另一方面，俄国依照18个月分期撤军的协定，上个月终于完全撤离东三省驻军，但留下8000名铁路工作人员。俄国外交部发表声明，留下的工作人员与其国防部毫无关系，工作范围仅限于铁路维修，人数也未超出条约的规定人数。
外务部与日使林权助在北京订立新奉、吉长铁路借款合同 。1905年，日俄战争结束双方议和时，俄以长春至大连铁路及其他支线与附带权利转让给日本，规定该铁路由中国自行筹筑，工款允向日本借款半数。本日，根据前约，清外务部大臣那桐、唐绍仪与日使林权助于本日在北京签订新（民屯）奉（天）、吉（林）长（春）铁路借款合同七款。议定吉长铁路自筹商股及向南满铁道株式会社所借贷款，均以该路产及进款担保，所筑吉长铁路必须与南满铁路连接。日本遂以借款方式，霸占修筑吉长铁路权利。6月1日，接收新奉铁路。次年11月12日，邮传部铁路总局局长梁士诒与日使馆书记官阿部守太郎订立新奉吉长铁路借款续约，总额日金247万元。1909年8月18日，邮传部与南满铁道株式会社订立新奉铁路借款细目合同。
4月16日。外务部照会日使林权助，南满铁路应由中日两国集股合办。1906年6月7日，日本政府单方面宣布成立“南满洲铁道股份公司”，清外务部多次抗议无效。本日，外务部再次照会日本驻京公使林权助，请依中俄原约遵行，彼此妥商集股办法，但日方置之不理。
4月17日。清考察政治馆获准专办《政治官报》。御史赵炳麟先于1906年11月奏请设立印刷官报局，办理官报，作为预备立宪基础。考察政治馆认为欲开民智、正民心，自非办理官报不可，为使国民皆能明悉国政，应汇集通国政治事宜，由馆派员专办一报，以归纳总流，启发群治。本日，清政府依议批准。《政治官报》遂于本年9月刊行。
4月18日。黑龙江全省学务处呈请筹办体育专科 。分为内外两班，各招生50名，先行试办内班（当时规定食宿者为内班）。
广东琼州南路续备军第五营士兵哗变。该营管带克扣月饷，士兵哗变，杀死哨官、管带，附近居民响应。
外务部照会俄公使璞科第，请速饬俄商交还黑龙江新旧各金矿。1901年，黑龙江将军与驻该省俄外交部代表订立暂准采勘金苗草约，并发给俄商采苗护照九张，其中四张有效期为两年，至本年早已过期，应予作废；其余五处，草约中特别声明漠河等五处旧矿不在准采界内；同时，草约中还规定：此约画押后，暂先勘探，俟清廷允许后再行研究。此后，俄商未经中国政府核准，即擅自开挖，并侵入观音山、漠河等处旧矿界内，清外务部以俄商擅逾权限，违背原约，遂照会俄使。
4月20日。清廷改革东三省官制。清廷以东三省吏治因循，亟应认真整顿，遂谕令盛京将军改为东三省总督，兼管三省将军事务，随时分驻三省行台，三省各设巡抚一名。任命袁世凯的幕僚长徐世昌为第一任东三省总督，徐得以钦差大臣身份兼管东三省军务。同时特任唐绍仪为奉天巡抚，朱家宝署理吉林巡抚，段之贵署理黑龙江巡抚，以示对袁氏北洋系安抚之意。
清军在奉天袭剿“马贼”。据4月20日《申报》载，清廷近日于奉天袭剿“马贼”，先后拿获刘担子、胡四、阎五、马老疙瘩、黄九、周恩波等首领。
邮传部议定各省借款开矿筑路，不得以路矿抵押。
4月23日。汉口杨家河船上黄陂、孝感两帮雇工数千人要求增加工资。将黄陂公所捣毁。
宁沪铁路工人数百人砸毁镇江洋务局。
4月25日。《民报》发行临时增刊《天讨》。中国同盟会之机关报《民报》在日本东京临时发行增刊《天讨》，由章太炎主编，内容设图画、插画、书檄、附录四栏，其中所刊之书檄13篇分别以军政府名义发布的《讨满洲檄》，四川、河南、安徽、山东、云南五省革命党人发布的讨满洲檄文，四川、江苏、直隶三省革命党人的《革命书》，另有《谕保皇会檄》、《谕立宪党》、《普告汉人》、《广东人对于光复前途之责任》四篇文檄。着重揭露清廷的腐败暴虐，号召人民“肃行天讨”，宣布革命政策，并附刊有为弹炸清廷出洋务大臣而殉难的革命志士吴樾的遗像和遗书。
黑龙江将军程德全照复驻哈日本总领事日人不得在中国非法居住经营。驳斥来照谓“日本臣民在中国不问城之内外，均得自由居住营业”及“日本臣民在中国贩卖铳炮不当加以没收、退去等之处罚”的无理要求。
筹措修筑粤汉铁路事宜。本日，清廷派伍廷芳、张振勋权理粤汉铁路公司事宜。7月11日，粤汉铁路公司董事局开会，通过议案九项，众股东投简公举总、协理。罗光廷当选为总理，黄景堂当选为协理。9月14