南疆的变化，对于京师的人们来说过于遥远，以这个时代的交通状况和信息传播速度，感觉上四川、湖南就十分遥远了，而云南简直远在天边，至于缅甸，很多人甚至把它等同于山海经、西游记中的怪兽和妖魔横行的世界，当莽应里被押赴菜市口凌迟处死时，还有不少百姓是为了看他现出妖怪的原形——结果当然令人很失望。
云南的战事，秦林夸官的荣耀，以及献捷午门和将俘虏押赴菜市口，在天子脚下、首善之区，也就热闹了这么几天而已，然后渐渐平息，大多数人说起这件事的时候，不过将它当作了茶余饭后的谈资，大约和说到“大唐贞观年间，御弟唐三藏取西经”、“永乐爷爷命三宝太监七下西洋”差不多。
朝廷官员和儒林士子对这件事的关注，则经历了一个渐次变化的过程：
当接到施甸被屠的消息时，他们感觉天朝上国的尊严受到了挑衅，违背了孔孟一脉相承的华夷秩序，并且引申到宋朝软弱以致华夏沦陷于蒙元的教训，强烈要求朝廷惩罚以莽应里为首的跳梁小丑。
接下来确定督师人选时，刚刚像打了鸡血的朝臣们又照例开始了推诿扯皮，谁也不想去接手云南那烂摊子，爱国这件事嘛，用嘴说就行了，既安全又保险，真要做起来，那可就不容易了。亏得秦林挺身而出，才结束了督师人选上的争论。
再之后，云南捷报频传。又有人开始后悔为什么自己没有接下督师重任，连秦林这个不通文墨的厂卫武臣都能把事情干好，老谋深算的文官去了岂不马到成功？白白把功劳让给他，真可惜。
等到饶仁侃、苏酂所犯罪行被报送京师，朝野又是一惊，这两位虽然早有贪墨之名，但没想到这么胆大妄为。竟敢欺上瞒下，事败之后还杀人灭口，熟读孔孟之书的两榜进士。怎么做得出这样的事情呢？
等到秦林凯旋回京，注意力又转移到对他封赏和册封思忘忧上，还没吵出个眉目。突然爆出秦督主怒打郑国舅的新闻，那些和秦林不大对付的官员，就喜滋滋的大有搬小马扎、准备瓜子花生好好看戏的心情。
没想到惊天大逆转，郑贵妃突然来了出绝缨会，不但没有唆使万历报复秦林，还“忍辱负重”，令郑国泰负荆请罪，成就了贤妃之名。
朝臣们惊愕之余，渐渐回过味来，“奸妃”和“佞臣”之间的关系根本没有之前想的那么简单嘛。只怕这就是他们联手做的一出戏！
偏偏这出戏演得丝丝入扣入木三分，就算有怀疑，也抓不到把柄，尤其是国舅爷郑国泰后期表演非常到位，本来三天两头不上朝去喝茶逛窑子遛鸟的一货。突然转了性子，每天一大早顶着满头纱布跑到紫禁城来上朝，那纱布还血迹斑斑，似乎在提醒遇到的每个人：看我被打得好惨。
自知上当的余懋学、顾宪成们把秦林和郑国泰恨得牙痒痒，混大明官场的哪个不是人精儿？你们这是侮辱了咱的人格，还要侮辱咱的智商啊！
“欲破秦贼。必先倒奸妃！”顾宪成如是说。
余懋学也表示：“秦贼纤芥之疾，立太子实一国之本，先立国本，而后论其他。”
清流们果然不是吃素的，就在午门献捷的第二天，万历一朝持续最长、对朝政影响最大、贻害最为深远的争国本案，横空出世！
放响当头炮的并非近来声誉鹊起的顾宪成，也不是老三大骂将余懋学、赵用贤、吴中行，新三大骂将江东之、羊可立、李植，而是此前名不见经传的户科给事中姜应麟。
姜给谏在奏章中说，这次征缅大捷，既是陛下洪福齐天、将士戮力建功，更是皇天后土庇佑、祖宗威灵显赫，所以应当趁此大捷，早立国本——也就是确定皇长子朱常洛为太子，让大明传承有序、皇统后继有人，以告慰列祖列宗在天之灵。
姜应麟是浙江慈溪人，而如今的清流中坚余懋学是江西婺源人，顾宪成来自江苏无锡，赵用贤江苏常熟，吴中行江苏武进，江东之安徽歙县……这些地方在当时要么属于南直隶，要么就是附近的江南地区，他们已在朝中隐隐结为一党，就是十多年后亮出招牌，左右大明朝局的，东林党！
此时虽无东林党之名，却有东林党之实，至于党争的种种手段，操弄朝局的诸般心术，余懋学顾宪成们也丝毫不陌生，由一个无名之辈出来放当头炮，不显山不露水的牵动朝局变化，诸位大人先生再摩拳擦掌随后跟进，这是大明朝官员们玩熟了的党争手段。
郑桢有了贤妃之名，万历自觉离废长立幼、最终册立郑桢为后的目标又近了一步，正在高兴头上接到这么份奏章，把他心头那点小盘算给全戳破了，立刻勃然大怒，说太子无非立嫡立贤立长，何用外臣催促，朕一切自有分寸，姜应麟无事生非，贬为大同广昌典史。
给事中属于六科，虽然从七品，职权却几可与部堂郎官相抗，典史却是知县下设的小吏，多大品级？不入流！
万历自以为这样做能唬住清流文官，可他忘了，文臣们连廷杖都不怕，又怎么会怕贬谪呢？这种简单粗暴的处理方法，只能起到捅破马蜂窝的效果。