安排好了之后，方家堰内的农民军开始缴械投降，然后上万黑骑军进入镇子中列阵，全程都是徐以显来组织人员变动，将妇女，小孩先分隔出来，然后就是将农民军的兵器，盔甲，马匹，弓箭……等等战斗物资全部收缴了，最后就是将那三万三千士兵给集结起来，然后整编，先给众人讲明白了，是自愿整编，愿意接受整编的，将会被分发到不同的军队当中，不愿意接受整编的，就继续跟着孙可望。
“徐军师，你归顺朝廷之后，到是很受器重嘛，这么大的事情，居然全部由你一人安排。”
孙可望看了又看都见不到熊文灿，只看见那一群带着面具的骑兵，还有徐以显一个人在这么指手画脚的，面对这个军师，他也没那么尊重了。
“我只不过是扶着招降而已，等人员分离出来之后，再由上面安排去处。”
徐以显也注意到了孙可望态度的转变，不过他也没在意，而且看着这些士兵，内心有点于心不忍，打算在说说一些话，暗示一下。
“大家要听从朝廷的安排，服从整编是最好的，大家听清楚了没有！”
“大家要听从朝廷的安排，服从整编是最好的，大家听清楚了没有！”
徐以显上马在人群中穿梭，一边大喊着，希望能让一些人改变注意，接受整编。
“整编之后的人会留在这里，跟你们家人一起留在里，你们想清楚了！”
他这么说也是权宜之计，先把那些人留下性命再说，其实这写人大部分都是襄阳府这附近的人，还有一部分是四川那边的百姓，他也只能说这么多，希望这些人能听懂一点别样的意思在里面，他都这么大声的吼叫了，这两句话，都是吼的很大声。
众人都不明所以的看着徐以显，有人的眼中是鄙视，有人的眼中是不解，之前还是他们的军师，下一刻摇身一变就成了明军的招降使，这转变的太快，让他们有点始料不及，而且他说的话是什么意思，他们也不是很明白，前面不是说自愿整编吗，怎么现在却在这里大吼大叫起来，不断的强调要服从整编，这是什么意思？
“哥，这是意思？”
人群中，有一十几岁的人看着身边的大哥不解的问道。
“我感觉，我们要接受整编了。”
大哥思考了一会，就说道。
“你刚才不还是说，跟着孙将军会自由一点，没有那么多规矩吗。”
“那是刚才，没看见徐军师在这里强调要服从整编吗。”
“那又怎么了？”
“叫你平时多读点书不听，史书上说，不接受整编的军队，有哪些是好过的，既然军师都不断强调要服从整编了，那他应该知道点内幕，再加上这奇怪的举动，服从整编最保险。”
众人议论纷纷，有人思考起来，有的人也不以为然。
孙可望也是奇怪的看着徐以显，感觉有什么不对，但是哪里不对也说不出来，就算希望大家都服从整编，也没必要这么强调吧，就这么不像让他掌握军队吗，他感觉就是熊文灿不想让他掌握太多军队，怕像之前张献忠一样突然再次反叛，不过他可没想过要一人独自造反，兵多兵少也无所谓，现在妥协也只是保全自己罢了，到时候去跟李自成，或者罗汝才汇合才行，不然光凭他一个人的力量没什么信心。
“服从整编的站这边，然后陆续离开方家堰，带外面列队等着！”
“不愿意整编留在原地就好！”
徐以显大声的解释着，然后开始分人员，首先第一个人走出来之后，有了带头的，后面就陆陆续续不断的有人从人群中走了出来，然后一个个的朝着镇子外面走去。
时间一点点的过去，直到旁晚时分，分离人员，到清点人数完毕，陈鹏带着一万黑骑军继续将方家堰给围住，里三层，外三层，而徐以显则是带着一群人，抱着上百本书册赶往远处的一处营地。
在大军的后方，朱慈烺就地扎营休息，旁晚十分，气温再次下降，很明显的可以感受到空气的寒冷，好在黑骑军的盔甲里面又棉衣，不然真要在冬季作战的话，非要冷死不可。
“殿下，徐以显在外面求见。”
张怀宾进来禀报。
“让他进来。”
朱慈烺从木板床上起来，来到火炉边坐下。
“快，搬进来。”
徐以显招呼着一群人将书册给搬进了帐篷，然后又挥手让这些人出去。
朱慈烺一看这些人的打扮就知道是一些百姓，估计是农民军里的人，在看着地上摆满了的书册，就问道：“这些是什么？”
“回殿下，这些是军名侧，是小的找了上百个会识字，写字的人记录的，记录了孙可望大军的人数的名侧，这里全是那些愿意服从安排整编人员的名侧，已经他们的家属人员的名侧，他们的家属大部分都在那两万四千人当中。”
徐以显解释着，又继续道：“孙可望的军队，包括家属人员，一共五万七千人，其中家属有两万四千人，士兵有三万三千人，其中