郑经和耿精忠早就约定好了反攻大陆，但耿精忠突然派兵来打自己，郑经倒也是不意外。毕竟耿精忠、尚可喜、吴三桂这三个人本来就是反复无常的小人，要不然清廷也不会封他们三个人为藩王。郑经见耿精忠如此反复无常，但郑经并不知道康熙就在金门，还以为这是耿精忠在向自己宣战，盛怒之下的郑经便拜被人誉为海霹雳的施琅为水师提督，让施琅好好的教训一下耿精忠。
此时的康熙已经返回京城处理紧公务，此刻清军最大的官自然也挨成了水师提督姚启圣，但郑经和耿精忠并不知情，因此明郑军和耿精忠的军队打的正欢，但明郑方面派出的则是海霹雳施琅，因此耿精忠的水师被打的节节败退，没多久耿精忠便退守厦门。
姚启圣早年经商，曾红色救助过因为战乱而流离失所的小施琅，因此姚启圣不光是施琅的启蒙老师，更是施琅的救命恩人。当姚启圣听说明郑军队的帅旗上绣着“施”字的时候，便亲自去观看战况。
姚启圣见明郑军的统帅打仗颇有自己的风格，而施琅又正好站在主战船的船头，姚启圣站在岸边说道：“小乞丐，果然是你呀”！
虽然此时的施琅已经是个中年人，但多年的朝夕相处，即使时隔三十多年，姚启圣还是一眼认出了施琅。但此时的施琅正在全力追击耿精忠的残军，根本就没有注意到金门的姚启圣，但也正因为如此，姚启圣也逃过一劫。原来施琅之所以被称为海霹雳，正是因为施琅善用火器，如果让施琅发现金门被清军占领，早就把从荷兰人手里抢来的大炮对准金门了。
荷兰在17世纪可是被誉为海上马车夫，其军事实力由此可见一斑。而耿精忠军队的火器更多是明朝留下的红衣大炮，而且红衣大炮又不适用于水战，战争只打了两个多小时，耿精忠最为精锐的水师就被施琅全歼了，耿精忠和施琅也就此结下了怨仇。但耿精忠的精锐全在厦门，施琅见久攻不下，只得放弃攻打厦门，先回金门再作打算。
当施琅赶到金门才发现金门早被清军占了，正当施琅和金门的清军进行炮战的时候，要不是姚启圣命人举白旗停战，只怕姚启圣早被施琅一炮炸死。施琅也是个火器天才，荷兰人的洋枪洋炮经过施琅的改造，其威力简直与传统的洋炮有着天壤之别。
姚启圣还想劝施琅归顺大清，但施琅却视明朝为正统，但又见自己的恩师归顺了清廷，两人自然也就不欢而散，但好在经过姚启圣再三挽留，施琅也不会被郑经逼的降清。
原来陈永华也从败军那得知金门失守，陈永华经过一个多月的准备，自认为可以将清军从金门赶出去，便带上精兵1700人，战舰17艘，以及洋炮50门，浩浩荡荡的杀奔金门。
当陈永华刚到金门，陈永华并没有下令攻打，而是命令船队返回台湾。