夜幕降临只有的爪哇海被火光照亮，已经混战在一起的战团此时已经偃旗息鼓，声音嘹亮的翻译军官用荷兰语、德语、法语、爪哇土著语对船上的荷兰人进行劝降，事实已经证明，无论是德约特还是哈鲁斯都已经抛弃了他们，舰队司令哈鲁斯直接跑的没影了，德约特的后卫舰队还有七艘船，此时在东北方向游弋，谁都知道，天亮前他会撤走，否则就会被拥有速度优势的巡航舰追上。
对荷兰人造成影响的不只有翻译官的提出的‘优渥条件’，还有船上水手的刀剑，在巴达维亚出发的时候，每一艘荷兰船都塞上了大量临时抓来的爪哇人和华人，在失败的战事中，这些心怀怨念的人被荷兰军官分发了武器，他们为了活命与合众国海军战斗，此时为了活命自然也是要与不肯投降的荷兰军官战斗，陆战队一艘一艘的接管荷兰人的船只，大大小小的帆艇在舰船之中穿梭，救助飘在海面上的人，在白日决战的战场，也有军人在忙活，偶尔还会响起一两声的火枪，那并非海军在处决落水水手，而是在驱逐、击杀趁火打劫的鲨鱼。
只有荷兰军官被陆战队看押起来，其余人，无论是白人、华人还是土著，都只是被收缴了武器罢了，在被俘虏之后，海军为其提供了一份食物，而在天亮之后，无论俘虏还是海军都加入到了修船之中，战斗已经结束了，大家都是一条船上的人，船若是沉没了，谁也捞不到好处。
最先的修船是进行损管作业，除了排水，就是堵住进水的孔洞，先保住船不沉没再说，之后才是恢复动力，修船一直持续了三天，爪哇海战的总结终于送达了李明勋的手中。
在整个爪哇海战中，巴达维亚舰队一共损失了三十九艘船，其中有被大舰队击沉的也有主动焚毁的，东印度公司方面，绝大部分的海军战舰被击毁，逃离的船只除了一些东印度大帆船，就是巡航舰、盖伦船一类的小型船，大舰队一共抓抓住了八千二百四十人的俘虏，其中白人和混血在两千八百人左右。在损失的三十九艘船中，有十二艘是被大舰队俘获的，实际上，巴达维亚舰队的损失不止这些，在逃亡途中，也有一些荷兰船只沉没或者被丢弃，而根据东印度公司的统计，在爪哇海战后，一共有三十五艘船逃回了荷兰控制的各个港口，回来的人数在一万两千人左右，也就是多达一万三千人战死或被俘、失踪。
合众国一方的损失也非常严重，因为大舰队是胜利者，所以可以非常细致的清点损失，大舰队总计损失了十一艘船，包含三艘逆戟鲸级的主力舰，两艘虎鲨级重炮舰，还有三艘盖伦船，一艘巡航舰和两艘护卫舰，此外，全舰队所有船只都遭受了不少的损伤，在回国过程中，还有两艘军舰因为遭遇恶劣天气，最终还是被放弃，爪哇海战之中，大舰队还能投入战斗的船只只剩下了十四艘。
唯一让李明勋感觉到庆幸的是，洲际贸易船和战列舰没有一艘沉没，洲际贸易船是因为一直没有承受艰难险重的任务，而战列舰纯粹是因为实力强横，而大部分的战果也与战列舰有关。
大战之后，重伤的海军军舰前往文岛港进行维修，部分船只返回了马尼拉和巴达维亚，而缴获的荷兰船只中，大部分就近在苏卡达纳、泗水等盟属港口维修。
可以说，爪哇海战决定了未来二十年谁是东方世界的海上霸主，而合众国显然抓住了这一机会，夺得了头把交椅，虽然大舰队损失严重，但逃走的巴达维亚舰队损失更大，哈鲁斯和德约特虽然逃跑方向不同，但是有一个共同认知，那就是合众国海军舰队会在取胜之后前往巴达维亚，所以这二人没有敢返回巴达维亚，德约特带领他的小舰队越过马六甲海峡前往了锡兰，在途中还突袭了槟城港和玻璃港，造成了不小的损失，而哈鲁斯直接前去了香料群岛，但无论哪个港口，都没有巴达维亚的修船能力，且双方交通联络困难，所以即便纸面数据上，荷兰人仍然占据优势，但海军掌握了爪哇海却是事实。
虽然在合众国与马打蓝联军登陆西爪哇，发动了围城战后，德约特和哈鲁斯都得到死命令，出战爪哇，但那个时候，合众国已经把战损和缴获的舰船维修好，在绝对实力上也占据了上风。
实际上，哈鲁斯和德约特的预料非常准确，在确定了控制战场局面之后，李明勋以鹰舰队为主，重组了一支特混舰队，包含了四艘战列舰和三艘重巡以及没有受损的七艘风帆护卫舰，执行对巴达维亚港口的封锁，这支舰队由李北极率领，于五天之后抵达了巴达维亚，并趁夜用炽热的炮弹炮击了巴达维亚城，用炮弹向巴达维亚的居民宣告，谁才是这片海洋的主宰。
李明勋和西蒙斯率领大队舰船返回了文岛港，并用通报船把爪哇海战胜利的消息传遍了合众国所有的行政区和所有的盟友，并且在台北和香港两地举行了两场献俘仪式，彻底宣告海战的胜利。
虽然海军陆战队一直在邦加岛和北大年枕戈待旦，但李明勋没有贸然发动登陆作战，那个时候，他还不知道德约特逃往了锡兰，哈鲁斯前去了香料群岛的安汶和班达，在失去敌人踪迹的情况下，李明勋必须做最坏的打算，那即是这些依旧拥有战斗力的船只会进