距今将近一万年前，光明祖神与黑暗祖神决斗，结果同归于尽。光明之剑与黑暗之剑分别坠落到两极，并分别孕育出了智慧树。人类借助智慧树上借出的智慧果的力量，开创了兵器文明时代。与此同时，各种各样的动物也受到了智慧树的恩泽，它们吃掉了智慧果，不仅拥有了人类的智慧，还拥有了强大的力量，被称为贤者生物；贤者生物之间彼此交配，又可以直接孕育出新的贤者生物，并将这力量传承了下去。
人类分为了光明军团和黑暗军团两大阵营，战争无休无止；与此相对，贤者生物却对人类的战争并不感兴趣，始终保持中立。起初人类并未掌握科技，人类畏惧贤者生物的力量，也不敢去招惹它们。然而战争促进了人类科技的飞速发展，拥有强大兵器的人类开始不再畏惧贤者生物，并开始将贤者生物作为战争资源进行猎捕，不久北半球的贤者生物就几乎灭绝了。面临生存危机的贤者生物开始南迁，并在南冥落脚作为圣域，根据种族不同形成了四大部落。之后贤者生物开始联合起来对付人类，将人类驱逐出圣域，并一点一点地夺取人类的土地，将那里变成人类无法居住的无人区。而无人区最终延伸到了南回归线，南回归线也成为了人类与贤者生物的边境线。
居住在圣域的贤者生物在出生后的十年内，往往和普通的生物没有什么区别；十年之后，智商开化；五十年后，身体出现明显异变；一百年后，拥有的力量已凌驾于人类之上；而要拥有人形，往往需要三百年以上的修行，一旦获得了人形，则寿命最多可延长到千年，成为大贤者生物。然而普通的贤者生物寿命只有二百年，所以有缘成为大贤者生物的屈指可数；而这些屈指可数的大贤者生物，也便拥有了成为圣域四领主之一的资格。
这一年，鱼岛的青龙国里出现了一位获得人形的家伙，然而奇怪的是他仅仅一百岁出头，他便是主父。此时首领青龙已经活了九百多岁，而国中又没有其他修炼成人形的同胞，他自然而然地就成为了下任青龙候选。然而这位青龙候选却从小向往人类的世界，而且觉得做一国之主实在麻烦，终于有一天他偷偷地溜走了。
不过主父作为贤者生物毕竟还太年轻，想法也难免天真，等待他的根本就不是自由。外边的世界正处于战乱中，为了让自己的军队在战争中取得优势，人类开发了拥有不可思议力量的兵器，有了那兵器，人类的力量甚至可以威胁到贤者生物，特别是还有人专门搞捕猎贤者生物的生意。
初来乍到时，主父自恃自己拥有超越人类的力量，想要靠自己的力量结束掉双方的争斗。在这期间，他在一个森林里看到两个小女孩被一群野兽围攻，便出手救了她们，并知道她们分别叫南月和北月，是一对姐妹。多年后，他渐渐发现就算自己是贤者生物，力量也是十分渺小的，根本无法改变现状分毫，他不仅战争没能停止，反而因为暴露身份成了众矢之的。有一日他遭到了黑暗军团的围捕，他被迫选择自保，解放了自己的力量，消灭了一个大队的人马。然而明枪易躲暗箭难防，他之后还是遭到了暗算，他头部受了伤，掉进了河里，被河水冲到了下游。
等到他醒过来时，已经失去了记忆，只记得自己名叫主父，还有多年前在森林里救下的那对姐妹。然而或许真是天赐良缘，后来将他救下的人正是当年那个叫南月的小女孩，她似乎是和祖母偶然游历到了这一带。尽管当年的小女孩已经成长为大姑娘，但主父还是认出了她。南月对主父也是细心照顾，没多久两人便产生了感情。
然而好景不长，之后医后和南月便听闻家中遭遇变故，南月的父亲遭到处决，母亲在孔明灯的保护下保住一命，但还是在牢狱中遭受折磨，而妹妹则流亡在外，生死未卜。祖孙俩自然很是着急，但贸然回家自然无异于自投罗网，就在两人一筹莫展之时，主父主动提出愿意帮助她们。那时南月就已经怀疑总帅的不太对劲，于是主父便负责前去取证。万万没想到的是一切进展得相当顺利，主父轻而易举地就获取到了一般人很难得知的核心内幕，这些核心内幕足以证明那个总帅是个冒牌货。在那之后孔明灯当上了总帅，没多久乔治一族便得以平反。
在那之后，主父和南月两人感情加深，后来名真言顺地结婚了，再后来南月生下一女鸣月。原本一切都应该很幸福美满地下去，然而在鸣月四岁那年，一切又发生了变故。有一天，主父突然恢复了记忆，于是他开始迷茫起来；好不容易决定留下来和人类继续生活下去，却不想没多久他的同伴又找到了他，说前一任青龙寿终正寝，要他回到鱼岛继承青龙之位，这让他再次迷茫了……
又有一天，南月突然对主父说，自己一个人会照顾好鸣月的，让他安心去做故乡的首领――原来南月早已察觉到主父并非人类。就这样，两人最后还是分别了，两人相约有缘再见，然而这一别便是永别……
“真是的，南月，不是说好有缘再见的吗？不是说好会好好照顾孩子的吗？怎么孩子还没养大，你就已经不在了呢？”青龙脸上浮现起鱼鳞哀叹道，“这下你们就应该明白怎么回事了。”
“真想不到这才