朱由检本来是想借尚可喜南下的机会，让尚可喜回到大明，然后收编了尚可喜的军队，同时将尚可喜治罪的。
但是局面似乎超出了朱由检的判断，首先就是尚可喜部将祖泽清的身份让参谋部犹豫不决。
祖泽清是祖大寿的儿子，祖泽清跟随尚可喜叛变满清，身在京城的祖大寿就受到了牵连。
虽然多尔衮和皇帝福临都没有大规模治理汉官，但是和叛军直接有关系的官员还是受到了处分。
其中就包括祖大寿，祖大寿的官职被罢免了，准备发配辽东充奴，毕竟他的儿子祖泽清跟随尚可喜叛乱了。
李岩随后向朱由检汇报了这个消息，朱由检得知祖大寿被罢官充奴之后，心中也有些忧虑。
祖大寿虽然是贰臣，但是祖大寿还有另外一个身份，那就是大明参谋部在京城的密探。
当年朱由检南迁之后，并没有放弃对京城情报的收集，朱由检令巩永固部署了一些锦衣卫的密探留在京城，继续探查京城的情报。
后来李自成败走，满清入主京城，锦衣卫的情报人员侦查到了不少满清的情报。
但是这些情报都是朝堂外面的情报，对于满清朝堂内部的情报，锦衣卫的密探很难探查到，因为他们伪装隐藏的身份都是一些普通百姓。
但是朱由检想要得到更多满清朝堂的情报，于是锦衣卫就开始暗中策动一些在满清效命的汉官。
尤其是那些身份特殊的汉官，他们在朝堂虽然有地位，但是满清权贵根本看不上他们，也不重用他们。
最后祖大寿就进入了锦衣卫的视野，而且祖大寿随着满清来到京城之后，就回到了当初他在京城的府邸。
此时府邸已经物是人非了，祖大寿不由的一阵感叹，当年他投降满清之后，他的家室就注定无法保全。
就在祖大寿感叹不已的时候，之前在祖府的一个家奴出现了，祖大寿立刻认出了这个家奴，两人顿时一阵感叹。
后来这个家奴就成为了祖大寿府上的重要仆人，也成为唯一一个令祖大寿放心的人。
虽然祖大寿投降了满清，荣华富贵不缺，可是祖大寿心中非常失落。
同样是降将的洪承畴等人，热衷功名，但是祖大寿自从投降之后，心中对名利暗淡了很多，也不热衷功名，多尔衮多次想要重用祖大寿，但是都被祖大寿婉拒了。
失落的祖大寿立刻进入了锦衣卫的视野，当初那个家奴也已经和锦衣卫联系上了，随后这个家奴出面，劝说祖大寿为大明效命。
一开始祖大寿还非常震惊，但是随着知道真相之后，他选择了默许，但是他没有直接同意为大明效命。
祖大寿平日里去兵部坐班，很容易接触到满清的军事情报，于是他都会记在心中。
等到晚上回到府上之后，都会整理记录，然后就放在书桌上面，他的那个家奴就会在祖大寿入睡之后，将书桌上面的情报拿走，交到锦衣卫密探手中。
于是就这样，大明在满清朝堂有了一个非常稳定的情报来源，当初桂王作乱的时候，祖大寿将多尔衮按兵不动的情报及时传出来了，让朱由检可以放手南下对付桂王。
后来张海山焚毁满清科举卷房也是祖大寿的功劳，福临令祖大寿奉命送试题，当时锦衣卫密探正苦恼没有下手的机会，祖大寿得到了进入考院的机会，于是张海山等人就跟随祖大寿混入了考院，最后焚毁了卷房。
至于在多尔衮和古特氏大婚的时候，张海山和宋赫混入皇城，制造爆炸之后脱身，都是祖大寿在暗中协助的。
几次重大行动之后，祖大寿已经成为大明在京城重要的密探之一，但是洪承畴的造反，迫使尚可喜也反叛满清，尚可喜的手下祖泽清就是祖大寿的儿子。
于是京城的祖大寿立刻受到了波及，就是多尔衮也没有吝惜，此时满清面临着非常严重的危机，加上祖大寿多次拒绝为多尔衮带兵打仗，看到祖大寿已经没有什么价值了，多尔衮也就不再摆花瓶做面子了，直接罢免了祖大寿的官职，然后将祖大寿充奴，准备送到辽阳劳动。
祖大寿的变故很快就传到了朱由检那里，朱由检知道祖大寿虽然是贰臣，但是他后来为大明做了不少事情。
尤其是在朱由检南迁最危难的时候，祖大寿选择了为大明提供情报，这就说明祖大寿的罪孽还不是很深。
此时祖大寿陷入危机，朱由检也动心了，他还是不想失去这个情报，而且祖大寿现在有一个非常大的好处，那就是福临非常看重祖大寿。
自从招祖大寿到身边讲学之后，福临几乎每天都要招祖大寿来讲学，福临非常喜欢祖大寿讲解的历史。
此时失去了祖大寿，朱由检认为是一个巨大的损失，大明不会赦免洪承畴、尚可喜之辈，但是祖大寿可以赦免，而且祖大寿非常重要，如果能够继续留在满清朝堂，还是留在福临身边，这对大明非常有力。
最后经过一番权衡，朱由检下令参谋部暗中策反祖泽清，令他背叛尚可喜，投奔满清