获得克罗格脑袋里面存储记忆的组织，尼克就建议奈特去到芳邻镇，想要通过记忆存储库里的阿马利博士获取更多的信息，这明显也是环环相扣的情节，不然哪里不拿，偏偏就拿隐藏在脑海中的合成物。
不过却是遇上了楚其琛，这是尚恩计划中出现的一个变数。
等一行人如愿的获得更进一步的信息，那就是去发光海找到叛变的学院科学家维吉尔。
到这里，男配角三号——维吉尔登场。
维吉尔虽然是一个比较胆小的科学家，但内心良知不允许他继续FEV实验，屡次要求停止FEV计划都被拒绝，而这个计划是圣父也就是尚恩坚持要搞的。
钻石城里的谣言说学院抓人去做合成人了，其实是对的也是不对的，往人体里插晶片（像克罗格那样）是上一代领袖（沃克博士）的做法，而老尚恩则反对这个路线。
他喜欢的是第三代合成人（毕竟是自己的DNA所构成），同时而抓人是用做FEV秘密实验，并且已经持续了十年。
而FEV病毒是战前英克雷搞砸的战争武器，地面上那些变异动物，包括超级变种人，都是FEV感染的后果，即便到后来也没搞出什么好的改进，无论是出于批量性杀掉或者拯救这些变异怪物以及联邦人，都似乎说不过去，毕竟学院本来就看不起当地面上的人。
到后面，维吉尔才借用实验事故，在自己体内植入FEV病毒，变成不怕辐射的超级变种人，逃出学院后躲到发光海里面。
其实维吉尔的逃亡也不能说是意外，说实话，要不是学院有意隐瞒了他的逃亡事件，让其他科学家都认为他死于实验事故，他一个原本手无缚鸡之力的变种人科学家怎么可能逃出深埋在地下的学院。
而他的逃亡路线，其实也一直在学院的掌控之中，通过死掉的克罗格脑海里面的记忆指引给奈特知道。
甚至可以说，这克罗格储存的记忆也是经过加工和挑选的，从他孩童时候到青年、中年等等经历一一节选出来呈献给奈特了解读取，而且都是对他人生影响相当大的关键节点，还有最重要的与小孩尚恩生活的情景以及学院科学家的维吉尔的行踪，让奈特有动力以及目标追踪下去。
不然按道理来说，即便是记忆读取，也应该是杂乱无章的，不可能这么条条有理，就像是在看纪录片一样，而且也少了他替学院干脏活的大量记忆，那可是足有六十年的时间，就这么凑巧‘丢失’了？
那只能说呵呵了。
更何况还有尼克凑合到这里充当读取播放器，学院要对这两者动手脚简直不要太方便了。
当然，有一个特殊状况，就是尼克受到克罗格记忆的影响，让奈特起了怀疑的心思，才没让他一同去发光海，不然以尼克这几乎没有什么电磁防护力量的躯体，去了就等于是送死。
不过现在有了楚其琛，也算是提前退场了。
而维吉尔最重要的作用，自然是给奈特提供进入学院的方式，实际上如果听过墨菲老妈的第三次‘预言’，也同样是这样提示他：“你正在往海里走去，但你怕的不是溺水，而是别的东西……无形……但……有光……它烧掉里头的一切，但……不……我可以感觉到他们。里面有人。在呼唤着什么，念诵着。他们会替你指点方向……但……他们很难看透……在他们身边要小心一点，孩子。”
看，分明就是发光海里面的情况以及原子神教的那些神经病啊！
而紧跟着维吉尔上场的，自然是这场戏剧的最重要的道具之一——Z2-47。
没错，这就是那个在联邦理工废墟追踪到的那个追猎者，这是最好控制的一个了，在奈特来到地盘后，才放出这个追猎者去追踪那逃跑的合成人珍妮。
不然怎么可能这么凑巧，刚来到这里，就有追猎者在学院附近执行回收任务。
这也是尚恩对奈特最后一个战斗考验，看能不能在学院最杰出的杀戮机器手中获胜，这也是对学院科技的一种战胜。
甚至墨菲老妈的第四次预言中，就有提到这个追猎者的情报：我看见你……是个强大的猎人……只不过你猎的不是动物，也不是人。是不一样的东西。也许是超越人类的东西。但……这是什么?我看见一个全身白装的男人。站在你的猎物前。他在说话……听不太清楚……但我正在努力，孩子……他说【Z2—47，重置原厂设定。授权码：Zeta53kilo】……然后他倒了下来……一动也不动……
实际上，还真有可能直接通过说这番话，让这个追猎者像那个合成人尚恩一样停机，这样就可以避免一场恶战，当然也有可能需要语音识别。
不过可惜，它遇到的是战斗能力非人存在的楚其琛，交手没几招就领便当去了，完全没有展现其能力所在。
紧接着的便是破解这个追猎者晶片的途径，有且仅有铁道组织这个地方。
原本铁道组织的头领戴斯德梦娜对他们是否进入学院挺犹豫的，却有一个人极力支持，这个人叫做迪耿，同样也是合成