人并不知道为什么朝廷会如此重视此事，但刘少卿是帮助皇帝做过兵棋推演的人，立刻就明白了皇上所预计的战争可能会提前爆发，于是立即将手中的工作交给宋庆，自己则火速返回盛京。
此时在朝鲜，因为鉴于继续对抗会引起外国武装干涉，东学党义军放弃了“驱兵入京”的计划，开始和朝鲜政府谈判。3日，高宗任命严世永为三南廉察使，金鹤镇为全罗道观察使，向东学军求和。严世永、洪启薰等人答应了东学军提出的12条改革方案，其中包括严惩贪婪暴虐的官吏、两班和富豪，取消封建等级制度，废除苛捐杂税和公私债务，废除奴婢和贱民制度，严惩私通日本者，平均分配土地等。高宗还将金文铉、赵秉甲、李容泰等人革职查办。6日，东学军撤出全州，并着手在其控制区内的53个郡县建立执纲所，作为自己的政权机构，以贯彻执行全州和议的12项改革方案，管理当地一切事务。
然而此时事态的发展早已不是朝鲜所能控制的了。
6月5日，日本即设立有参谋总长、参谋次长、陆军大臣、海军军令部长等参加的“大本营”，作为指挥侵略战争的最高领导机关。就在全州合议达成之时，日本先遣队大岛义昌少将率领混成旅团第一批部队在仁川登陆，此时在朝的日军比起驻朝清军已占据优势；而在日军先遣队出发前，日本外务大臣陆奥宗光训令驻朝公使大鸟圭介“得施行认为适当之临机处分”，授权大鸟挑起衅端。
此时，袁世凯的部队刚刚达全州。
同一天，在长崎访问的中国舰队，接到了由汪凤藻发来的密信。
在接到朝廷旨意的当天，汪凤藻就准备通知丁汝昌，然而这时候他突然发现，自己向外传递消息的渠道已经被日本控制了。在这种情况下，汪凤藻不知道自己所传递的消息是否能够被传递出去，于是他想了一个办法，通过之前几任大使建立的情报网络雇佣了一名日本官员，将这封密信带到了长崎。所以在时间上，就完了几天。就是在这几天的时间里，日本国内已经完成了最后的战争准备。
接到信件的是‘镇远’号管带林泰曾，因为当时丁汝昌及其他几位海军官员正在出席一场由日本参谋长有栖川宫炽仁亲王主持的酒会不在舰上，而送信的人又比较着急，就将信交给了林泰曾。
林泰曾拿着信，犹豫着要不要打开。
按照海军的规定，当第一军事长官不在岗位上时，次级军事长官自动接替他的岗位，履行他的职责。按照这个规定，现在在舰上的第一军事长官就是林泰曾，所以他有权查看任何信件。
但是林泰曾这个人性格比较谨慎，说白了就是有些优柔寡断，他在想万一这封信是给丁汝昌的私人信件，而里面又恰好写了一些不方便别人知道的事情，到时候丁军门回来，大家面上尴尬，以后就不好共事了。所以，林泰曾最终决定将信收起来，等丁汝昌回来后交给他。
如果海军没有施行宪兵制度，这件事就会这样发展下去，然而，在三年前，海军就开始加入了宪兵制度，随后，每一艘军舰上都会有一队执法官，负责督导军舰的日常军纪。此时在‘镇远’号上自然也有这么一帮人，而且林泰曾的身边就恰恰有一位。
“大人，按照规定，您应该立即打开信件，了解我国驻日大使给我军发来什么样的消息。”
军法官刘振军表情严肃的道。
林泰曾有些无奈的看了看这位年轻的近卫军军官。军法官不归他管而是直属于黄成涌，所以自己的命令在这些一根筋的士兵面前没有任何用处。
“这封信可能是丁大人的私人信件……”林泰曾尝试着解释。
“也可能不是！”刘振军明显不买账。
“那你看！”林泰曾赌气的将信件推给刘振军。但是刘振军丝毫不为所动：“按照规定，我无权查看。而大人您，则必须查看。”
刘振军的语调平静，但很坚定。
‘啪，’林泰曾一拍脑门，心中道了声‘矮服了幼’，只能打开信件看了起来。
还好，这封信不是私人信件，但是信中的内容却让林泰曾皱起了眉头。
信件很简单，只有三句话：朝鲜发生暴乱。皇上命我转告，注意日本人，如果可能，立即返航。我已被日本人监视，建议你们立即返航。
林泰曾不清楚朝鲜究竟发生了什么，但是‘立即返航’四个字确看得清清楚楚。然而，问题来了。丁汝昌和一部分军官仍在城里，怎么返航？
难道要丢下领导不管？这明显不合适。于是林泰曾只能通知轮机长，给锅炉加煤加水，做好生火的准备。
然而，轮机长给出的答复让林泰曾始料未及。
船上的煤、水不足。
原来，‘镇远’在来日本之前，并没有将舰上的煤、水加满。因为日本距离中国不远，没必要一次性加那么多煤，而且由于惯例，到日本后会有日本当局负责给到访的军舰补充煤和水，所以‘镇远’以及‘经远’、‘济远’都只加了足够来到日本的燃料，而没有携带回去的！