见毛文龙对前两条都不满意，侯恂又说：“第三，如毛总兵愿意接受指挥，朝廷将把与毛总兵不和的登、莱巡抚武之望调走另派人来并补足粮饷，但东江军得接受朝廷委派的御史监军，由御史监军帮助毛总兵管束部队。”
见毛文龙还在考虑，侯恂说道：“第四，如毛文龙继续百般推托，就将其麾下的东江军排除在大明军队序列之外，降其为义军不再发粮饷让其凭军功领取报酬。这是皇上原话。”
毛文龙一听大急，说道：“文龙生是大明的人，死是大明的鬼，无论如何都不愿意脱离大明军队成为义军。文龙愿意接受朝廷指挥，也愿意朝廷派驻监军，只要皇上信任文龙愿意肝脑涂地。”
侯恂说：“既然毛总兵选择第三条，那么明天本钦差就可以派人把粮饷调过来。毛总兵请起，现在首先请说说你东江军有多少士兵？”说完冷冷地看着毛文龙。
毛文龙咽了口口水说：“可战之兵共有两万。”
侯恂说：“好，那就暂时以两万发粮发饷，其他人就不考虑了，他们如果在这生活有困难可以去辽东军事管制区。”
毛文龙想了想点了点头同意了，继而问侯恂道：“女真人出兵就在这几天，明后天有了粮饷我们是攻辽阳还是取耀州？只有攻取大点的城才能把女真人打痛让他们退兵，不然起不到牵制的作用。”
侯恂先唤过一个亲兵来让他找人立即带上自己亲笔信去登州，明天让祖大寿派两千人押运足够两万人马耗用的粮草银子过来。吩咐完后拿出一张小型地图对毛文龙说：“先休息个十天半个月，估计女真人到了宁远关下再出兵。我带了五千人来，加上你的两万人到时候一起攻取旅顺。”
毛文龙皱眉道：“旅顺城墙坚固不好强攻，万一敌人再来增援就麻烦了。”
侯恂说：“女真人出动十三万人去取宁远，辽阳和沈阳还要人守，旅顺有没有一千人都是没准的事，我两万人还攻不下来？再说我也不是真的想先取旅顺，我的真实目的是先取南关。”
毛文龙看了看地图说：“嗯，南关到金州这一带左右都是海，陆地最多十多里宽而且中间多为山地不利于骑兵冲锋。如果侯大人想永久占据这里，可以先派一万人监视住旅顺守军，然后用剩下的一万五千人占住南关到金州这一咽喉要地，起边墙修城堡后再反手过来瓮中捉鳖，旅顺之敌就无路可逃。”
侯恂说：“怎么用兵你是行家，占据南关后尽快修城建堡，先建简易点等天热解冻后再加固扩宽，总之要趁机把南关以南变成大明的自留地，努尔哈赤想取宁远总得付出点代价。”
正月十三日上午，军务院接到登州发来的六百里加急塘报，毛文龙同意朝廷派驻御史监军，登州已向其部发送粮饷，东江军可战之兵两万人现待命随时可以出击。随同一起来的还有军情处的最新情报，努尔哈赤率十三万人兵临辽河，接到信后天启立即来到军务院开会商议。
在明军与女真人对峙时，辽河与大凌河入海段是双方的缓冲区，现努尔哈赤兵临辽河就意味着战事即将拉开。最早时大家还有些紧张，但经过一番布置后反而感到很轻松。这事情就是这样，既然躲不过就要去勇敢面对，当准备得很充分时，心里不但不再紧张反而有那么一丝丝期待。
看着桌子上铺开的地图，孙承宗首先说：“以敌人的行军速度，如果这两天过河，沿途的右屯、锦州、松山、塔山又没有抵抗，那么十天内敌人就会抵达宁远关。宁远关狭窄敌人人再多也展不开，正面破关的可能性不大，两翼摆开同时进攻的可能性很大。”
天启点了点头说：“预先的攻防已经演习过好多次，为了预防万一，军参处张祥安、孙传庭和倪元璐三位明天就带着四百人出发，朕派三千护军一路护送，到了宁远后让三千护军回京时顺便把孙元化和茅元仪护送回来。在宁远首先要保护好自己，一到宁远立即宣旨让赵率教带两万人移师出海，与侯恂汇合去进攻旅顺同时攻占南关建关城。”
新上任的军机大臣袁可立笑着说：“看来皇上对宁远之战有必胜信心，皇上有信心臣等也是信心倍增。”
王在晋说：“赵率教手下那几万预备队打仗不行修城建堡是老手，皇上如果真想在南关与金州之间修永久性关城，那就得分兵防守，到时候我军就要在宁远、南关、东江等三处防守，天暖了还要去大凌河谷古道建城，这样一来兵力会不会太分散了？”
见孙承宗、王永光等都望着自己，知道他们都跟王在晋有同样看法，天启说：“力分则弱，进攻也好防守也好分兵确实是一大忌讳，但朕要这样做是有一定考虑的。在跟大家解释之前，朕想问在坐各位一个问题，就是你们认为大明与女真人之间应该是一种什么样的关系？”
孙承宗说：“奴酋努尔哈赤原来也接受我大明官职，后来造反现在还妄自立国，这等背主之徒必须赶净杀绝！”
王永光也说道：“孙大人所言极是，这种人应该灭族！”
见大家都点头称是，天启说：“朕看你们都是读书人，以为你们要说出一番‘